217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1833 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1833  peptidase M19, renal dipeptidase  100 
 
 
393 aa  790    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0564  peptidase M19, renal dipeptidase  56.66 
 
 
390 aa  418  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0752699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3395  peptidase M19, renal dipeptidase  57.72 
 
 
411 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2447  peptidase M19 renal dipeptidase  51.66 
 
 
388 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.234226 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  49.36 
 
 
393 aa  355  5.999999999999999e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0282  peptidase M19, renal dipeptidase  49.48 
 
 
386 aa  345  6e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00197146  normal  0.781669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3564  peptidase M19, renal dipeptidase  48.48 
 
 
387 aa  334  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388396  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  47.7 
 
 
397 aa  332  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3261  peptidase M19, renal dipeptidase  44.62 
 
 
394 aa  309  6.999999999999999e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35092  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2850  peptidase M19 renal dipeptidase  48.36 
 
 
389 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.25923  normal  0.0171201 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4040  peptidase M19, renal dipeptidase  49.56 
 
 
223 aa  216  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  33.15 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  30.7 
 
 
311 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  29.86 
 
 
311 aa  130  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  27.45 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  30.03 
 
 
444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  31.1 
 
 
315 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  31.02 
 
 
355 aa  126  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  30.25 
 
 
333 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  27.78 
 
 
438 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  28.9 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  26.56 
 
 
415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  27.33 
 
 
312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  30.6 
 
 
399 aa  120  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  32.06 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  28.38 
 
 
360 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  29.46 
 
 
394 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  27.09 
 
 
355 aa  113  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  28.25 
 
 
307 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  27.18 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  30.16 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  29.53 
 
 
352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  26.79 
 
 
399 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  28.57 
 
 
307 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  26.25 
 
 
419 aa  109  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  27.52 
 
 
444 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  27.6 
 
 
307 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  28.81 
 
 
342 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  27.6 
 
 
307 aa  105  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  27.6 
 
 
307 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  27.6 
 
 
307 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  27.6 
 
 
307 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  26.78 
 
 
602 aa  105  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  27.27 
 
 
307 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  25.68 
 
 
326 aa  105  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  28.19 
 
 
348 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2089  Membrane dipeptidase  27.62 
 
 
307 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  28.37 
 
 
354 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  26.67 
 
 
344 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  32.99 
 
 
307 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  29.1 
 
 
412 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  27.27 
 
 
307 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  26.58 
 
 
311 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  30.22 
 
 
420 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  25.87 
 
 
307 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  24.65 
 
 
346 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  27.18 
 
 
342 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  27.2 
 
 
325 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  30.56 
 
 
297 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  24.65 
 
 
346 aa  100  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  27.99 
 
 
392 aa  100  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  33.71 
 
 
307 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  28.41 
 
 
353 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  32.71 
 
 
315 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  25.97 
 
 
429 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  25.07 
 
 
320 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  25.84 
 
 
317 aa  98.2  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  23.88 
 
 
409 aa  98.6  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  24.03 
 
 
323 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  28.35 
 
 
324 aa  97.4  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  26.24 
 
 
323 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  31.13 
 
 
306 aa  97.4  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  26.88 
 
 
405 aa  97.4  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  28.2 
 
 
325 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  23.96 
 
 
323 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  26.09 
 
 
323 aa  96.3  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  25.53 
 
 
323 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  26.81 
 
 
323 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  26.81 
 
 
323 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  25.86 
 
 
325 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1304  peptidase M19, renal dipeptidase  29.55 
 
 
349 aa  95.9  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.53734  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  29.55 
 
 
349 aa  95.9  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  26.81 
 
 
323 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  26.81 
 
 
323 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  26.81 
 
 
323 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  26.81 
 
 
323 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  26.81 
 
 
323 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  31.47 
 
 
307 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3591  membrane dipeptidase  26.12 
 
 
428 aa  95.5  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  25.18 
 
 
323 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  23.89 
 
 
323 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4039  Zn-dependent dipeptidase  44.54 
 
 
155 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  27.34 
 
 
320 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  25.53 
 
 
323 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  25.42 
 
 
433 aa  95.1  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  25.18 
 
 
323 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  25.21 
 
 
346 aa  94.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  25.18 
 
 
323 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  27.63 
 
 
332 aa  94  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  25.18 
 
 
323 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>