217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1105 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  100 
 
 		 332 aa  688    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  65.84 
 
 		 324 aa  461  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  62.27 
 
 		 328 aa  448  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  63.47 
 
 		 325 aa  441  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  61.61 
 
 		 325 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  60.8 
 
 		 325 aa  432  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  61.99 
 
 		 320 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  61.61 
 
 		 325 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  60.99 
 
 		 325 aa  431  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  60.37 
 
 		 325 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  60.99 
 
 		 325 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  60.37 
 
 		 325 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  60.37 
 
 		 325 aa  424  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  60.37 
 
 		 325 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  60.37 
 
 		 325 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  59.94 
 
 		 323 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  58.57 
 
 		 323 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  59.01 
 
 		 323 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  59.01 
 
 		 323 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  57.63 
 
 		 323 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  58.7 
 
 		 323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  58.7 
 
 		 323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  58.7 
 
 		 323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  58.7 
 
 		 323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  58.7 
 
 		 323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  58.07 
 
 		 323 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  58.07 
 
 		 323 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  57.76 
 
 		 323 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  57.01 
 
 		 323 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  57.45 
 
 		 323 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  57.45 
 
 		 323 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  57.45 
 
 		 323 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  57.45 
 
 		 323 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  57.45 
 
 		 323 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  57.14 
 
 		 323 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  55.45 
 
 		 323 aa  391  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  54.83 
 
 		 323 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  37.07 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  38.24 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  38.24 
 
 		 328 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  39.2 
 
 		 336 aa  235  9e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  36.96 
 
 		 323 aa  219  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  34.8 
 
 		 326 aa  215  7e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  33.33 
 
 		 329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  34.37 
 
 		 329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  33.95 
 
 		 329 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  33.64 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  33.02 
 
 		 329 aa  207  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  33.54 
 
 		 329 aa  206  5e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  33.64 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1602  peptidase M19, renal dipeptidase  37.19 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.184491  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  34.86 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  33.72 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  32.26 
 
 		 357 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  31.16 
 
 		 311 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  29.31 
 
 		 386 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  34.75 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  30.09 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  32.72 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  30.74 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  27.42 
 
 		 433 aa  133  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  28.95 
 
 		 315 aa  133  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  28.79 
 
 		 400 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  27.51 
 
 		 379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  29.17 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  30.8 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3174  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  28.96 
 
 		 399 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845004  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  29.93 
 
 		 390 aa  123  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  30.45 
 
 		 332 aa  123  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  28.36 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  29.26 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  29.43 
 
 		 602 aa  115  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  31.2 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  26.16 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  26.42 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  25.21 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  24.67 
 
 		 381 aa  112  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  29.59 
 
 		 315 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  26.37 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  29.48 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  27.63 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  29.32 
 
 		 355 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  28.16 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  25 
 
 		 419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  33.71 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  28.7 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  33.54 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  29.06 
 
 		 335 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  30.08 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  32.93 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  32.93 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  33.78 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  27.33 
 
 		 394 aa  106  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  32.93 
 
 		 307 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  32.93 
 
 		 307 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  32.93 
 
 		 307 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  27.73 
 
 		 444 aa  105  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  25.2 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  31.25 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  29.37 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>