212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03501 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03501  dipeptidase  100 
 
 		 444 aa  903    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  62.03 
 
 		 413 aa  449  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  40.49 
 
 		 409 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  45.31 
 
 		 412 aa  300  4e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  43.11 
 
 		 405 aa  292  8e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  40.99 
 
 		 449 aa  280  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  37.87 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  39.39 
 
 		 392 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  32.44 
 
 		 399 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  30.45 
 
 		 439 aa  180  4e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3582  peptidase M19, renal dipeptidase  32.68 
 
 		 431 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3591  membrane dipeptidase  32.9 
 
 		 428 aa  169  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  31.97 
 
 		 444 aa  156  9e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  32.46 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  28.61 
 
 		 420 aa  139  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  29.7 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  31.44 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4213  dipeptidase, putative  29.7 
 
 		 462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  32.33 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1643  peptidase M19, renal dipeptidase  28.26 
 
 		 472 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2156  renal dipeptidase family protein  28.99 
 
 		 447 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0303403  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1966  peptidase M19, renal dipeptidase  28.5 
 
 		 464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0692763  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  28.87 
 
 		 419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3785  peptidase M19 renal dipeptidase  29.1 
 
 		 448 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  25.81 
 
 		 438 aa  129  9.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3537  peptidase M19 renal dipeptidase  28.02 
 
 		 450 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1853  peptidase M19, renal dipeptidase  26.38 
 
 		 456 aa  123  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  27.13 
 
 		 602 aa  121  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25440  Peptidase M19, renal dipeptidase.PvdM-like protein  27.05 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2866  putative dipeptidase precursor  27.18 
 
 		 448 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  28.78 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33730  putative dipeptidase precursor  27.12 
 
 		 448 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.180184  hitchhiker  0.00270503 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  27.51 
 
 		 429 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  31.7 
 
 		 433 aa  108  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  30 
 
 		 412 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  28.61 
 
 		 381 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  25.71 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  30.55 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  28.27 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  29.73 
 
 		 350 aa  100  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  24.43 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  30.45 
 
 		 368 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  29.72 
 
 		 329 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  24.06 
 
 		 328 aa  97.1  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  23.27 
 
 		 311 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0651  Membrane dipeptidase  25.31 
 
 		 419 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.720054  normal  0.102026 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  27.19 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  30.3 
 
 		 418 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  26.72 
 
 		 348 aa  89.4  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  25.71 
 
 		 315 aa  88.6  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  24.77 
 
 		 312 aa  87.8  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  27.69 
 
 		 307 aa  87.8  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  27.96 
 
 		 359 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  29.19 
 
 		 335 aa  86.7  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  23.72 
 
 		 311 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1833  peptidase M19, renal dipeptidase  36.99 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  25.99 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  25.22 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  37.1 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  26.58 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  36.55 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  23.69 
 
 		 317 aa  82.4  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  23.28 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  26.24 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  25.63 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  23 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0564  peptidase M19, renal dipeptidase  31.02 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0752699 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  24.89 
 
 		 311 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  26.27 
 
 		 355 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  30.41 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  21.5 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  28.64 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  25.69 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0326  peptidase M19 renal dipeptidase  31.11 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  27.94 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2447  peptidase M19 renal dipeptidase  30.5 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4040  peptidase M19, renal dipeptidase  32.06 
 
 		 223 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4792  periplasmic dipeptidase  36.63 
 
 		 102 aa  75.1  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.31108 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  28.08 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  29.27 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3505  peptidase M19, renal dipeptidase  25.59 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  27.31 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  23.41 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  27.22 
 
 		 327 aa  72.8  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3261  peptidase M19, renal dipeptidase  31.94 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35092  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  22.79 
 
 		 337 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2850  peptidase M19 renal dipeptidase  30.77 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.25923  normal  0.0171201 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  23.88 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0751  twin-arginine translocation pathway signal  28.3 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1296  peptidase M19 renal dipeptidase  36.67 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.488471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3564  peptidase M19, renal dipeptidase  27.94 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  25.56 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  26.07 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  23.29 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0032  peptidase M19, renal dipeptidase  38.89 
 
 		 307 aa  69.7  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  24.86 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  31.19 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  27.62 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  23.27 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  25.47 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>