198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4792 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4792  periplasmic dipeptidase  100 
 
 
102 aa  210  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.31108 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  48.04 
 
 
399 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  51.96 
 
 
402 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  48.04 
 
 
399 aa  105  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  45.1 
 
 
444 aa  102  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  45.71 
 
 
439 aa  98.6  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  43.56 
 
 
602 aa  95.5  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  37.62 
 
 
444 aa  91.3  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  43.56 
 
 
412 aa  90.9  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  43.56 
 
 
409 aa  90.1  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  39.05 
 
 
433 aa  85.9  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  40.4 
 
 
392 aa  85.1  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  43.14 
 
 
438 aa  85.5  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  41 
 
 
405 aa  83.6  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  43 
 
 
415 aa  83.2  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  38 
 
 
449 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  37.62 
 
 
413 aa  77.8  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  36.79 
 
 
429 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  37.38 
 
 
338 aa  77  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03501  dipeptidase  36.63 
 
 
444 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3537  peptidase M19 renal dipeptidase  33.64 
 
 
450 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  38.24 
 
 
420 aa  72.4  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  35.29 
 
 
419 aa  71.2  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  33.96 
 
 
348 aa  70.9  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3582  peptidase M19, renal dipeptidase  34.58 
 
 
431 aa  70.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  34.31 
 
 
433 aa  70.5  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  35.64 
 
 
402 aa  69.3  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  33.33 
 
 
412 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  33.33 
 
 
350 aa  67.8  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  33.33 
 
 
388 aa  67  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  34.34 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  34.31 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2866  putative dipeptidase precursor  32.71 
 
 
448 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  30.39 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  34.65 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2156  renal dipeptidase family protein  31.78 
 
 
447 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0303403  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1853  peptidase M19, renal dipeptidase  31.78 
 
 
456 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3591  membrane dipeptidase  36.45 
 
 
428 aa  66.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33730  putative dipeptidase precursor  32.71 
 
 
448 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.180184  hitchhiker  0.00270503 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  35.29 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  32.35 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4213  dipeptidase, putative  30.84 
 
 
462 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  34.31 
 
 
320 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  35 
 
 
328 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  35 
 
 
328 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1643  peptidase M19, renal dipeptidase  31.78 
 
 
472 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  34 
 
 
342 aa  64.3  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3785  peptidase M19 renal dipeptidase  30.84 
 
 
448 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1966  peptidase M19, renal dipeptidase  30.84 
 
 
464 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0692763  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  34.31 
 
 
320 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  35.64 
 
 
332 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  33 
 
 
317 aa  62  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25440  Peptidase M19, renal dipeptidase.PvdM-like protein  30.84 
 
 
423 aa  60.8  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  33.33 
 
 
418 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  31.37 
 
 
412 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  32.35 
 
 
312 aa  60.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  32.32 
 
 
306 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  30.61 
 
 
307 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  33.33 
 
 
390 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0651  Membrane dipeptidase  31.31 
 
 
419 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.720054  normal  0.102026 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  29.41 
 
 
333 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  35.11 
 
 
357 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3174  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  30.39 
 
 
399 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845004  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  31.37 
 
 
363 aa  57  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  33.67 
 
 
323 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  31.73 
 
 
352 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  31.18 
 
 
332 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  32.99 
 
 
323 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4040  peptidase M19, renal dipeptidase  25.49 
 
 
223 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  30.39 
 
 
333 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  25.49 
 
 
327 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  31.96 
 
 
323 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  27.45 
 
 
377 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  32.65 
 
 
307 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  29.41 
 
 
400 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  31.25 
 
 
355 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  34.02 
 
 
323 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  32.99 
 
 
323 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  32.99 
 
 
323 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  32.99 
 
 
323 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  28.28 
 
 
326 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  31 
 
 
329 aa  55.1  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  29.59 
 
 
315 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  32.99 
 
 
323 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  32.99 
 
 
323 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  32.99 
 
 
323 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  32.99 
 
 
323 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  32.99 
 
 
323 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  32.65 
 
 
328 aa  55.1  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3700  peptidase M19 renal dipeptidase  31.3 
 
 
388 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.56612 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  33.33 
 
 
307 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  32.99 
 
 
323 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3509  peptidase M19 renal dipeptidase  31.3 
 
 
388 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  29.81 
 
 
352 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  32.99 
 
 
323 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  32.99 
 
 
323 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  32.99 
 
 
323 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  32.99 
 
 
323 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0910  peptidase M19, renal dipeptidase  32.89 
 
 
324 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  32.99 
 
 
323 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>