217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3448 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  100 
 
 		 333 aa  678    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  37.9 
 
 		 329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  39.88 
 
 		 335 aa  205  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  35.06 
 
 		 332 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  32.49 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  33.54 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  35.16 
 
 		 400 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  31.83 
 
 		 325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  31.6 
 
 		 323 aa  146  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  30.52 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  34.28 
 
 		 307 aa  142  7e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  29.97 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  32.58 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3174  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  33.76 
 
 		 399 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845004  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  32.19 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  30.86 
 
 		 328 aa  136  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  28.57 
 
 		 323 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  29.55 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  31.29 
 
 		 323 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  29.55 
 
 		 323 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  29.55 
 
 		 323 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  28.8 
 
 		 332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  29.5 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  29.5 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  29.5 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  30.06 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  30.92 
 
 		 328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  29.35 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  31.16 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  31.16 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  29.96 
 
 		 324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  31.16 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  31.16 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  31.16 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  31.1 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  30.31 
 
 		 325 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  30.53 
 
 		 328 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  27.87 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  30.07 
 
 		 348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  30.82 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  30.82 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  30.71 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  31.45 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  31.2 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  30.31 
 
 		 325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  30.31 
 
 		 325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  30.31 
 
 		 325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  30.31 
 
 		 325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  32.5 
 
 		 333 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  30.31 
 
 		 325 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  30.89 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  30.31 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  29.92 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  30.53 
 
 		 377 aa  123  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  30.31 
 
 		 325 aa  123  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  29.96 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  30.68 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  30 
 
 		 357 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  31.19 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  30.77 
 
 		 311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  24.91 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  36.81 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  31.6 
 
 		 444 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  35.88 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  29.32 
 
 		 313 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  32.43 
 
 		 602 aa  115  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  29.82 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  30.95 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  31.34 
 
 		 307 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  31.34 
 
 		 307 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  30.82 
 
 		 399 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  30 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  35.11 
 
 		 345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  30.88 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  29.26 
 
 		 326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  26.01 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  29.95 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  28.99 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  29.95 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  30.88 
 
 		 307 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0838  peptidase M19, renal dipeptidase  31.51 
 
 		 388 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  32.24 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  29.9 
 
 		 402 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  34.47 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  30 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  31.67 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  29.49 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  29.49 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  27.89 
 
 		 438 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  29.49 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  29.49 
 
 		 307 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  31.72 
 
 		 329 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  29.03 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  30.67 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  26.8 
 
 		 311 aa  106  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  27.38 
 
 		 329 aa  105  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3700  peptidase M19 renal dipeptidase  30.56 
 
 		 388 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.56612 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3577  peptidase M19 renal dipeptidase  31.02 
 
 		 388 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  28.52 
 
 		 379 aa  105  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3107  peptidase M19, renal dipeptidase  28.1 
 
 		 385 aa  105  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.178357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>