213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0578 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  100 
 
 		 336 aa  701    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  69.28 
 
 		 326 aa  482  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1602  peptidase M19, renal dipeptidase  64.58 
 
 		 323 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.184491  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  63.02 
 
 		 328 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  62.7 
 
 		 328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  59.49 
 
 		 332 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  51.4 
 
 		 327 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  51.75 
 
 		 329 aa  357  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  51.1 
 
 		 329 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  51.41 
 
 		 329 aa  356  2.9999999999999997e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  52.06 
 
 		 329 aa  356  2.9999999999999997e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  51.41 
 
 		 346 aa  354  1e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  50.79 
 
 		 329 aa  349  4e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  40.75 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  39.2 
 
 		 332 aa  235  9e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  36.25 
 
 		 323 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  36.31 
 
 		 323 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  35.62 
 
 		 323 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  35.31 
 
 		 323 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  37.04 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  35.8 
 
 		 323 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  35.8 
 
 		 323 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  35.8 
 
 		 323 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  35.8 
 
 		 323 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  35.8 
 
 		 323 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  35.8 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  35.8 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  35.78 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  34.88 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  34.88 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  35.33 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  34.57 
 
 		 323 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  35.46 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  35.71 
 
 		 325 aa  206  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  34.57 
 
 		 323 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  34.57 
 
 		 323 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  35.4 
 
 		 325 aa  206  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  34.57 
 
 		 323 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  34.57 
 
 		 323 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  35.14 
 
 		 320 aa  205  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  35.46 
 
 		 324 aa  205  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  35.78 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  33.95 
 
 		 323 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  34.26 
 
 		 323 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  34.81 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  35.14 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  34.81 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  35.14 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  34.06 
 
 		 325 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  32.02 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  32.63 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  30.42 
 
 		 368 aa  156  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  27.69 
 
 		 386 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  29.49 
 
 		 327 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  33.19 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  31.95 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  26.23 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3174  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  34.76 
 
 		 399 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845004  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  26.07 
 
 		 311 aa  122  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  28.18 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  33.69 
 
 		 400 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  30.56 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  28.5 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  27.87 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  30 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3791  renal dipeptidase family protein  25.97 
 
 		 396 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  29.61 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  28.61 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  27.36 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  33.49 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0806  peptidase M19, renal dipeptidase  28.51 
 
 		 387 aa  106  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3577  peptidase M19 renal dipeptidase  28.38 
 
 		 388 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  27.18 
 
 		 335 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3700  peptidase M19 renal dipeptidase  27.93 
 
 		 388 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.56612 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3183  twin-arginine translocation pathway signal  29.6 
 
 		 388 aa  106  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0741  peptidase M19 renal dipeptidase  27.93 
 
 		 388 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3509  peptidase M19 renal dipeptidase  27.93 
 
 		 388 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3133  twin-arginine translocation pathway signal  28.51 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0834  twin-arginine translocation pathway signal  26.86 
 
 		 387 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  23.79 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  30.6 
 
 		 381 aa  102  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0751  twin-arginine translocation pathway signal  29.57 
 
 		 391 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  31.61 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  28.94 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0838  peptidase M19, renal dipeptidase  27.03 
 
 		 388 aa  99.8  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  25.62 
 
 		 399 aa  99  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3756  peptidase M19, renal dipeptidase  27.03 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  35.1 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  28.3 
 
 		 444 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  27.36 
 
 		 329 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  32.73 
 
 		 429 aa  97.1  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  30.67 
 
 		 333 aa  96.3  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  31.11 
 
 		 332 aa  95.9  8e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  32.31 
 
 		 394 aa  95.9  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0845  peptidase M19 renal dipeptidase  24.04 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.773406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  32.35 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3107  peptidase M19, renal dipeptidase  24.13 
 
 		 385 aa  95.1  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  24.17 
 
 		 348 aa  95.1  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  29.73 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  27.39 
 
 		 333 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>