266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004235 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0529  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  71 
 
 
471 aa  679    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.702922  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2757  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  71.82 
 
 
472 aa  717    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04108  fused trehalose(maltose)-specific PTS enzyme: IIB component/IIC component  70 
 
 
473 aa  690    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4843  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  69.79 
 
 
472 aa  669    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5762  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  70 
 
 
473 aa  672    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.742409  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3754  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  69.57 
 
 
473 aa  667    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4721  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  70 
 
 
473 aa  672    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.612827 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4737  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  70 
 
 
472 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4706  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  69.79 
 
 
472 aa  696    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000162291  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4856  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  69.79 
 
 
472 aa  696    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000588436  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3771  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  69.79 
 
 
473 aa  670    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01205  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  97.01 
 
 
468 aa  916    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004235  phosphotransferase system trehalose-specific IIBC component  100 
 
 
474 aa  954    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712328  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1507  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  72.34 
 
 
472 aa  715    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.44731  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4801  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  69.79 
 
 
472 aa  696    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.318828  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4835  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  70 
 
 
472 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0431  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  71.64 
 
 
471 aa  684    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0495  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  71.86 
 
 
471 aa  686    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04072  hypothetical protein  70 
 
 
473 aa  690    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4812  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  70 
 
 
472 aa  690    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0522  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  78.51 
 
 
486 aa  765    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0439  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  70.21 
 
 
473 aa  696    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0577  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  86.29 
 
 
474 aa  834    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1163  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  72.07 
 
 
483 aa  687    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.348607 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0432  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  85.86 
 
 
478 aa  842    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00257211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4494  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  70 
 
 
472 aa  690    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0769  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  61.7 
 
 
474 aa  579  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0077  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  53.59 
 
 
643 aa  501  1e-140  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.569592  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0541  PTS system, trehalose-specific IIBC component  54.26 
 
 
473 aa  498  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1335  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  52.56 
 
 
497 aa  493  9.999999999999999e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135548  hitchhiker  0.00345051 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0473  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  53.93 
 
 
481 aa  486  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0192  PTS system, IIABC components  48.45 
 
 
676 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2418  PTS system, glucose-like IIB subunint  49.69 
 
 
489 aa  436  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000324347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0699  PTS system, trehalose-specific IIBC component  43.7 
 
 
475 aa  395  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.712537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0598  PTS system trehalose-specific transporter subunit IIBC  43.7 
 
 
475 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0356425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0631  PTS system trehalose-specific transporter subunit IIBC  43.7 
 
 
475 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0542  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (PTS system, trehalose-specific IIBC component)  43.49 
 
 
475 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0542  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (PTS system, trehalose-specific IIBC component)  43.49 
 
 
475 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.190354  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0667  PTS system, trehalose-specific IIBC component  43.28 
 
 
475 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.652435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4670  PTS system, trehalose-specific IIBC component  43.49 
 
 
475 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.21575e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0760  PTS system, trehalose-specific IIBC component  43.7 
 
 
475 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0686  PTS system, trehalose-specific IIBC component  43.49 
 
 
475 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.872474 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0544  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  43.91 
 
 
475 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1620  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  42.33 
 
 
471 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000938635  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2554  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  43.25 
 
 
472 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0597  PTS system, sucrose-specific IIBC component  38 
 
 
479 aa  328  9e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000306243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0508  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  39.87 
 
 
475 aa  327  3e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0495  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  39.87 
 
 
475 aa  327  3e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.247391  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000599  phosphotransferase system sucrose-specific IIBC component  36.48 
 
 
479 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000683079  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2449  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  36.78 
 
 
480 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000521739  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2403  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  36.78 
 
 
480 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000860113  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0972  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  37.16 
 
 
485 aa  310  4e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0102663  normal  0.021269 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1968  PTS system, sucrose-specific IIBC components  37.11 
 
 
481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000108474  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl500  trehalose PTS system IIABC component  37.33 
 
 
519 aa  307  3e-82  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3657  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  36.25 
 
 
478 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0525  PTS system, trehalose-specific IIB component  57.62 
 
 
273 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.346126  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3507  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  36.57 
 
 
458 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3757  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  35.48 
 
 
456 aa  268  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0342215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2907  PTS system sucrose-specific EIIBC component ScrA  35.71 
 
 
456 aa  267  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119328  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3594  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  36.15 
 
 
456 aa  266  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1778  sucrose PTS, EIIBCA  35.19 
 
 
647 aa  261  2e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000018652  hitchhiker  0.000000000675608 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2021  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  35.42 
 
 
456 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0349  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  35.99 
 
 
456 aa  259  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1285  PTS system, sucrose-specific (IIBC component) transmembrane protein  34.48 
 
 
465 aa  259  9e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.410172  normal  0.484299 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4205  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  35.56 
 
 
456 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0393  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  36.74 
 
 
457 aa  256  9e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3433  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  34.5 
 
 
462 aa  253  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0288  sucrose PTS, EIIBCA  32.7 
 
 
653 aa  244  3e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0534348  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0810  PTS system, sucrose-specific IIBC component  32.56 
 
 
458 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0718  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  32.56 
 
 
458 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000127924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0754  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  32.56 
 
 
458 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0668  PTS system, sucrose-specific IIBC component  32.35 
 
 
458 aa  230  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00638232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0917  PTS system, sucrose-specific IIBC component  32.14 
 
 
458 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1785  PTS system, sucrose-specific IIBC component  30.7 
 
 
450 aa  223  8e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000306537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1513  PTS system, sucrose-specific IIBC component  30.7 
 
 
450 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000189676  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0398  sucrose PTS, EIIBCA  35.12 
 
 
654 aa  222  9.999999999999999e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000327344  hitchhiker  0.00000162153 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1690  PTS system, IIABC components  31.46 
 
 
639 aa  218  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151541  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1710  sucrose PTS, EIIBCA  31.58 
 
 
633 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433436  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3482  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  31.39 
 
 
644 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl431  trehalose/sucrose/beta-glucoside PTS system IIBC component  32 
 
 
514 aa  209  9e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126698  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0282  PTS system, IIBC components  32.82 
 
 
461 aa  208  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0253  PTS system, glucose-like IIB subunint  33.64 
 
 
474 aa  207  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00830451  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0747  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  29.25 
 
 
638 aa  206  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0763  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  29.03 
 
 
626 aa  203  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0859  PTS system, beta-glucoside-specific enzyme II, ABC component  28.98 
 
 
630 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4064  phosphotransferase system EIIC  28.93 
 
 
462 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0877  PTS system, beta-glucoside-specific enzyme II, ABC component  29.01 
 
 
630 aa  190  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324408  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4255  phosphotransferase system EIIC  28.87 
 
 
460 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0933  phosphotransferase system, EIIC  29.29 
 
 
459 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.393836  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2323  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  29.36 
 
 
621 aa  186  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl516  sucrose PTS system IIBC component  29.24 
 
 
572 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.804375  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4074  phosphotransferase system EIIC  29.07 
 
 
470 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1470  phosphotransferase system EIIC  28.41 
 
 
450 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0563215  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0980  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  29.65 
 
 
639 aa  179  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.668297  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0744  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  29.2 
 
 
634 aa  179  8e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0784  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  30 
 
 
636 aa  179  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.063374  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0976  phosphotransferase system EIIC  29.83 
 
 
450 aa  178  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180134  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0790  PTS system, beta-glucosides-specific IIABC components  27.25 
 
 
622 aa  171  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.933117  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0535  beta-glucoside-specific PTS system IIABC component  32.43 
 
 
654 aa  171  4e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000350615  hitchhiker  0.00000000000038873 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1755  beta-glucosides PTS, EIIBCA  29.68 
 
 
624 aa  170  4e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000638137  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>