191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2949 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2949  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  100 
 
 
150 aa  306  5e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  35.04 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  31.58 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  34.31 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  33.33 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2898  arsenate reductase  35.04 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.871154  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  34.31 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  35.16 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  35.34 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  33.81 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  33.58 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  34.31 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  33.81 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  33.81 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  33.09 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  33.09 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  33.1 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  36.15 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  33.58 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  33.82 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2062  arsenate reductase  34.31 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  30.66 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1707  arsenate reductase  32.84 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0993958  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  36.3 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  33.61 
 
 
132 aa  67  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3186  arsenate reductase (thioredoxin)  35.04 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.08 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  30.63 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  32.12 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.65 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  28.78 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  31.06 
 
 
131 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.83 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.65 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  29.29 
 
 
150 aa  60.8  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  31.58 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  30.22 
 
 
294 aa  60.5  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.82 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  35.11 
 
 
138 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11640  protein-tyrosine-phosphatase  34.33 
 
 
138 aa  60.5  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.181279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  30 
 
 
157 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.08 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0820  protein tyrosine phosphatase  28.67 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.580395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
258 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.66 
 
 
137 aa  58.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  28.99 
 
 
453 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.29 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  28.28 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  25.58 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  29.41 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.1 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  25.87 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0666  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  27.69 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  31.58 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.08 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.15 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  29.37 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  31.39 
 
 
215 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  29.01 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  29.55 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3381  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  26.92 
 
 
130 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  28.37 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  29.58 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  28.26 
 
 
140 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2722  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  26.92 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5510  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  30.22 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000212559  unclonable  3.15729e-26 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.32 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.95 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.58 
 
 
136 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  28.57 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  30.53 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  30.83 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  29.71 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  33.33 
 
 
248 aa  53.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2481  protein tyrosine phosphatase  30.43 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  30.23 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  27.34 
 
 
225 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1656  protein tyrosine phosphatase  28.17 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0413264  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5441  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  28.99 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2860  arsenate reductase  30.43 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.796184  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.5 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  26.67 
 
 
145 aa  52.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  29.29 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2232  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.69 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  28.23 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  28.78 
 
 
223 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  29.93 
 
 
408 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  27.82 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  28.57 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  26.32 
 
 
152 aa  52  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  29.69 
 
 
139 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  28.79 
 
 
287 aa  51.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  24.48 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  27.34 
 
 
222 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  29.32 
 
 
498 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  29.71 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  27.74 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  24.09 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  33.08 
 
 
337 aa  50.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  26.98 
 
 
137 aa  50.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>