52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4095 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4095  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  558  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3777  AMP-dependent synthetase and ligase  48.52 
 
 
274 aa  175  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0710  hypothetical protein  43.96 
 
 
301 aa  166  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.668983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7617  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  44.4 
 
 
298 aa  165  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2525  hypothetical protein  42.86 
 
 
390 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376562  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0938  hypothetical protein  49.4 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4336  hypothetical protein  40.38 
 
 
266 aa  133  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00845407  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0880  hypothetical protein  46.75 
 
 
229 aa  132  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0751009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1060  hypothetical protein  35.06 
 
 
228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13297  hypothetical protein  39.3 
 
 
229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000791055  normal  0.907531 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5904  hypothetical protein  41.09 
 
 
321 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.638533 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06060  conserved hypothetical protein TIGR03089  37.12 
 
 
235 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.100534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1725  hypothetical protein  35.07 
 
 
236 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1334  hypothetical protein  36.88 
 
 
243 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453667  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1317  hypothetical protein  36.88 
 
 
243 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1353  hypothetical protein  36.88 
 
 
243 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4738  hypothetical protein  34.5 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715967  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1851  hypothetical protein  36.11 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1406  hypothetical protein  34.85 
 
 
246 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2505  hypothetical protein  34.69 
 
 
252 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1024  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6350  hypothetical protein  36.36 
 
 
230 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.965008  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1205  hypothetical protein  36.19 
 
 
252 aa  97.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08510  conserved hypothetical protein TIGR03089  34.39 
 
 
235 aa  97.8  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.342847 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3868  hypothetical protein  42.34 
 
 
243 aa  96.3  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  decreased coverage  0.0012235 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1262  hypothetical protein  44.44 
 
 
242 aa  94  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000677178 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09050  hypothetical protein  37.57 
 
 
269 aa  89.4  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.026099  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2550  hypothetical protein  38.32 
 
 
245 aa  87.8  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1191  hypothetical protein  39.87 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2348  hypothetical protein  57.14 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0075811  hitchhiker  0.000005957 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1692  AMP-dependent synthetase and ligase  26.02 
 
 
560 aa  72.8  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0924914  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4213  hypothetical protein  35.42 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal  0.28556 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1862  hypothetical protein  27.34 
 
 
255 aa  67  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.50666  hitchhiker  0.00495036 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05260  hypothetical protein  47.5 
 
 
217 aa  50.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.571136  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  32.91 
 
 
552 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2687  putative long-chain-fatty-acid CoA ligase  39.53 
 
 
503 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.714201 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  32.91 
 
 
552 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20810  hypothetical protein  31.71 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193012  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  45.21 
 
 
4165 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  24.89 
 
 
725 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  24.89 
 
 
725 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  35.87 
 
 
545 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  27.19 
 
 
578 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2795  acetoacetyl-CoA synthetase  34.4 
 
 
652 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  0.10488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2720  acetoacetyl-CoA synthetase  34.95 
 
 
653 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.199771  normal  0.0612564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3071  acetoacetyl-CoA synthetase  32.8 
 
 
650 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.922751  normal  0.501607 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1510  AMP-dependent synthetase and ligase  24.74 
 
 
584 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79948  hitchhiker  0.00072846 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1534  AMP-dependent synthetase and ligase  24.74 
 
 
584 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1416  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 
584 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498039  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1054  AMP-dependent synthetase and ligase  24.74 
 
 
584 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  23.77 
 
 
662 aa  42.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 
584 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.877669  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2653  acetoacetyl-CoA synthetase  33.6 
 
 
650 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>