33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2505 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2505  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  506  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0938  hypothetical protein  42.29 
 
 		 229 aa  131  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0880  hypothetical protein  40 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0751009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4336  hypothetical protein  37.66 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00845407  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06060  conserved hypothetical protein TIGR03089  34.38 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.100534 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4095  hypothetical protein  37.75 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3777  AMP-dependent synthetase and ligase  38.39 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6350  hypothetical protein  35.25 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.965008  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5904  hypothetical protein  32.12 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.638533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0710  hypothetical protein  31.58 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.668983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7617  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  36.16 
 
 		 298 aa  99.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2525  hypothetical protein  33.85 
 
 		 390 aa  95.9  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376562  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1851  hypothetical protein  39.76 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13297  hypothetical protein  33.48 
 
 		 229 aa  87  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000791055  normal  0.907531 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1060  hypothetical protein  33.06 
 
 		 228 aa  85.9  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1353  hypothetical protein  38.55 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1334  hypothetical protein  38.55 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453667  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1317  hypothetical protein  38.55 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4738  hypothetical protein  32.93 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1725  hypothetical protein  51.25 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1406  hypothetical protein  40.23 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09050  hypothetical protein  33.58 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.026099  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4213  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal  0.28556 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2348  hypothetical protein  45.83 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0075811  hitchhiker  0.000005957 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2550  hypothetical protein  48.61 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3868  hypothetical protein  34.59 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  decreased coverage  0.0012235 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1262  hypothetical protein  33.78 
 
 		 242 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000677178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1191  hypothetical protein  36.91 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1862  hypothetical protein  31.21 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.50666  hitchhiker  0.00495036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1205  hypothetical protein  32.5 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08510  conserved hypothetical protein TIGR03089  35.23 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.342847 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20810  hypothetical protein  31.87 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193012  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05260  hypothetical protein  32.68 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.571136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>