33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1862 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1862  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  511  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.50666  hitchhiker  0.00495036 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09050  hypothetical protein  41.98 
 
 		 269 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.026099  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2348  hypothetical protein  42.28 
 
 		 244 aa  150  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0075811  hitchhiker  0.000005957 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2550  hypothetical protein  41.49 
 
 		 245 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1205  hypothetical protein  39.57 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3868  hypothetical protein  37.82 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  decreased coverage  0.0012235 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1262  hypothetical protein  31.91 
 
 		 242 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000677178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1191  hypothetical protein  30.24 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20810  hypothetical protein  42.77 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193012  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08510  conserved hypothetical protein TIGR03089  35.45 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.342847 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3777  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7617  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  30.67 
 
 		 298 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4095  hypothetical protein  29.34 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1406  hypothetical protein  27.62 
 
 		 246 aa  62  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0938  hypothetical protein  34.03 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1353  hypothetical protein  32.64 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1334  hypothetical protein  32.64 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453667  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0880  hypothetical protein  32.89 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0751009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1317  hypothetical protein  32.64 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06060  conserved hypothetical protein TIGR03089  33.12 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.100534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1851  hypothetical protein  32.32 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05260  hypothetical protein  35.66 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.571136  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2525  hypothetical protein  29.89 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376562  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2505  hypothetical protein  31.91 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1060  hypothetical protein  31.88 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4336  hypothetical protein  44.83 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00845407  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1725  hypothetical protein  30 
 
 		 236 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0710  hypothetical protein  26.59 
 
 		 301 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.668983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5904  hypothetical protein  40.91 
 
 		 321 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.638533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4738  hypothetical protein  32.77 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13297  hypothetical protein  48.15 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000791055  normal  0.907531 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4213  hypothetical protein  44.44 
 
 		 265 aa  49.3  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal  0.28556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6350  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  45.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.965008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>