34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6350 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6350  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  450  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.965008  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06060  conserved hypothetical protein TIGR03089  55.13 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.100534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13297  hypothetical protein  43.23 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000791055  normal  0.907531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1317  hypothetical protein  46.31 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1334  hypothetical protein  46.31 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453667  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1353  hypothetical protein  46.31 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1725  hypothetical protein  43.83 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1060  hypothetical protein  41.74 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4738  hypothetical protein  44.26 
 
 		 244 aa  141  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4336  hypothetical protein  43.5 
 
 		 266 aa  135  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00845407  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1851  hypothetical protein  42.26 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0880  hypothetical protein  41.7 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0751009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0938  hypothetical protein  43.5 
 
 		 229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7617  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  39.38 
 
 		 298 aa  114  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2505  hypothetical protein  35.25 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4095  hypothetical protein  36.33 
 
 		 286 aa  99  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3777  AMP-dependent synthetase and ligase  41.58 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0710  hypothetical protein  34.13 
 
 		 301 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.668983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1406  hypothetical protein  36.18 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08510  conserved hypothetical protein TIGR03089  33.75 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.342847 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2525  hypothetical protein  42.22 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5904  hypothetical protein  33.85 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.638533 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2348  hypothetical protein  37.56 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0075811  hitchhiker  0.000005957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4213  hypothetical protein  41.55 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal  0.28556 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1191  hypothetical protein  36.09 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1262  hypothetical protein  35.61 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000677178 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09050  hypothetical protein  43.81 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.026099  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3868  hypothetical protein  39.44 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  decreased coverage  0.0012235 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2550  hypothetical protein  48.68 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05260  hypothetical protein  46.75 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.571136  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1862  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  45.8  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.50666  hitchhiker  0.00495036 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20810  hypothetical protein  44.44 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193012  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1205  hypothetical protein  29.67 
 
 		 252 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2687  putative long-chain-fatty-acid CoA ligase  35.11 
 
 		 503 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.714201 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>