43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06060 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_06060  conserved hypothetical protein TIGR03089  100 
 
 		 235 aa  461  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.100534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6350  hypothetical protein  55.13 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.965008  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4738  hypothetical protein  46.58 
 
 		 244 aa  161  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1060  hypothetical protein  42.49 
 
 		 228 aa  161  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1725  hypothetical protein  45.73 
 
 		 236 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13297  hypothetical protein  43.04 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000791055  normal  0.907531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1317  hypothetical protein  44.44 
 
 		 243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1334  hypothetical protein  44.44 
 
 		 243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453667  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1353  hypothetical protein  44.44 
 
 		 243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1851  hypothetical protein  42.54 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4336  hypothetical protein  40.57 
 
 		 266 aa  125  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00845407  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0880  hypothetical protein  44.05 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0751009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0938  hypothetical protein  45.25 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4095  hypothetical protein  37.64 
 
 		 286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7617  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  38.24 
 
 		 298 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3777  AMP-dependent synthetase and ligase  39.76 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2505  hypothetical protein  34.31 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1406  hypothetical protein  35.71 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5904  hypothetical protein  33.98 
 
 		 321 aa  101  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.638533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0710  hypothetical protein  33.06 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.668983 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08510  conserved hypothetical protein TIGR03089  36.48 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.342847 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09050  hypothetical protein  38.61 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.026099  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2525  hypothetical protein  34.69 
 
 		 390 aa  90.9  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376562  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3868  hypothetical protein  39.75 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  decreased coverage  0.0012235 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1191  hypothetical protein  39.01 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2348  hypothetical protein  51.95 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0075811  hitchhiker  0.000005957 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2550  hypothetical protein  39.74 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4213  hypothetical protein  33.47 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal  0.28556 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1262  hypothetical protein  34 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000677178 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1862  hypothetical protein  33.12 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.50666  hitchhiker  0.00495036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1205  hypothetical protein  33.77 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05260  hypothetical protein  43.21 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.571136  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20810  hypothetical protein  45 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193012  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.26 
 
 		 562 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.556582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1339  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.65 
 
 		 562 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.697994  normal  0.273492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.65 
 
 		 562 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4550  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.65 
 
 		 562 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1824  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.26 
 
 		 562 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.919675  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1495  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.45 
 
 		 562 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0186  AMP-dependent synthetase and ligase  28.14 
 
 		 503 aa  45.4  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2687  putative long-chain-fatty-acid CoA ligase  33.33 
 
 		 503 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.714201 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3845  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.84 
 
 		 562 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3836  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.84 
 
 		 562 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.934306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>