33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1406 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1406  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  484  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7617  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  40.24 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4095  hypothetical protein  34.47 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0710  hypothetical protein  36.47 
 
 		 301 aa  102  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.668983 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06060  conserved hypothetical protein TIGR03089  35.71 
 
 		 235 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.100534 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4336  hypothetical protein  35.46 
 
 		 266 aa  96.3  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00845407  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08510  conserved hypothetical protein TIGR03089  34.63 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.342847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0938  hypothetical protein  36.03 
 
 		 229 aa  91.7  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0880  hypothetical protein  35.22 
 
 		 229 aa  90.5  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0751009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1060  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  89.4  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5904  hypothetical protein  39.43 
 
 		 321 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.638533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3868  hypothetical protein  36.82 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  decreased coverage  0.0012235 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13297  hypothetical protein  35.32 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000791055  normal  0.907531 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6350  hypothetical protein  36.18 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.965008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3777  AMP-dependent synthetase and ligase  36.51 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1851  hypothetical protein  39.16 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09050  hypothetical protein  31.11 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.026099  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1191  hypothetical protein  32.42 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2525  hypothetical protein  34.25 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376562  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2505  hypothetical protein  40.23 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2550  hypothetical protein  33.91 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1205  hypothetical protein  35.43 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1353  hypothetical protein  34.38 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1334  hypothetical protein  34.38 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453667  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1317  hypothetical protein  34.38 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4738  hypothetical protein  32.48 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2348  hypothetical protein  47.56 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0075811  hitchhiker  0.000005957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1725  hypothetical protein  34.18 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1862  hypothetical protein  27.62 
 
 		 255 aa  62  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.50666  hitchhiker  0.00495036 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20810  hypothetical protein  39.57 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193012  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4213  hypothetical protein  31.33 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal  0.28556 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1262  hypothetical protein  44.71 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000677178 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05260  hypothetical protein  38.06 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.571136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>