33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08510 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_08510  conserved hypothetical protein TIGR03089  100 
 
 
235 aa  460  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.342847 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1205  hypothetical protein  43.11 
 
 
252 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2550  hypothetical protein  42.86 
 
 
245 aa  122  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1191  hypothetical protein  40.17 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09050  hypothetical protein  41.56 
 
 
269 aa  118  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.026099  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3868  hypothetical protein  47.56 
 
 
243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  decreased coverage  0.0012235 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1262  hypothetical protein  38.33 
 
 
242 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000677178 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2348  hypothetical protein  45.45 
 
 
244 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0075811  hitchhiker  0.000005957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4095  hypothetical protein  34.39 
 
 
286 aa  98.6  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7617  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  34.47 
 
 
298 aa  98.2  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06060  conserved hypothetical protein TIGR03089  36.48 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.100534 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1406  hypothetical protein  34.63 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1851  hypothetical protein  41.45 
 
 
237 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4336  hypothetical protein  37.35 
 
 
266 aa  87.8  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00845407  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6350  hypothetical protein  33.75 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.965008  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1862  hypothetical protein  35.45 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.50666  hitchhiker  0.00495036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3777  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1725  hypothetical protein  36.84 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4738  hypothetical protein  37.84 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715967  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13297  hypothetical protein  33.19 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000791055  normal  0.907531 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1060  hypothetical protein  33.82 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20810  hypothetical protein  39.09 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193012  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2525  hypothetical protein  34.78 
 
 
390 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376562  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1353  hypothetical protein  34.39 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1334  hypothetical protein  34.39 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453667  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1317  hypothetical protein  34.39 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0938  hypothetical protein  35.37 
 
 
229 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0880  hypothetical protein  35.37 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0751009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0710  hypothetical protein  31.14 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.668983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5904  hypothetical protein  42.86 
 
 
321 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.638533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2505  hypothetical protein  35.23 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1024  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05260  hypothetical protein  38.53 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.571136  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4213  hypothetical protein  27.03 
 
 
265 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal  0.28556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>