33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1060 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1060  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  457  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1725  hypothetical protein  48.03 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1317  hypothetical protein  46.58 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1334  hypothetical protein  46.58 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453667  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1353  hypothetical protein  46.58 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13297  hypothetical protein  46.02 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000791055  normal  0.907531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4738  hypothetical protein  47.16 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1851  hypothetical protein  47.39 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06060  conserved hypothetical protein TIGR03089  42.49 
 
 		 235 aa  161  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.100534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6350  hypothetical protein  41.74 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.965008  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0880  hypothetical protein  42.04 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0751009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0938  hypothetical protein  41.15 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4095  hypothetical protein  35.06 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4336  hypothetical protein  38.17 
 
 		 266 aa  118  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00845407  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0710  hypothetical protein  34.45 
 
 		 301 aa  109  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.668983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7617  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  35.19 
 
 		 298 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5904  hypothetical protein  34.24 
 
 		 321 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.638533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3777  AMP-dependent synthetase and ligase  38.67 
 
 		 274 aa  95.9  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1406  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  89.4  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2525  hypothetical protein  37.06 
 
 		 390 aa  88.6  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376562  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1191  hypothetical protein  38.03 
 
 		 261 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3868  hypothetical protein  37.97 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  decreased coverage  0.0012235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2505  hypothetical protein  32.23 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1262  hypothetical protein  36.67 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000677178 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08510  conserved hypothetical protein TIGR03089  33.82 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.342847 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2550  hypothetical protein  34.09 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09050  hypothetical protein  30.59 
 
 		 269 aa  62  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.026099  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2348  hypothetical protein  38.82 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0075811  hitchhiker  0.000005957 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1205  hypothetical protein  34.04 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1862  hypothetical protein  31.88 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.50666  hitchhiker  0.00495036 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4213  hypothetical protein  33.59 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal  0.28556 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20810  hypothetical protein  31.85 
 
 		 236 aa  52  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193012  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05260  hypothetical protein  44.07 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.571136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>