41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7617 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7617  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  100 
 
 		 298 aa  594  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4095  hypothetical protein  44.11 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2525  hypothetical protein  39.84 
 
 		 390 aa  143  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3777  AMP-dependent synthetase and ligase  45.03 
 
 		 274 aa  142  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0710  hypothetical protein  39.36 
 
 		 301 aa  142  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.668983 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13297  hypothetical protein  41.48 
 
 		 229 aa  138  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000791055  normal  0.907531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1725  hypothetical protein  39.91 
 
 		 236 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1406  hypothetical protein  41.3 
 
 		 246 aa  136  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4336  hypothetical protein  42.15 
 
 		 266 aa  132  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00845407  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1317  hypothetical protein  40.17 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1334  hypothetical protein  40.17 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453667  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1353  hypothetical protein  40.17 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4738  hypothetical protein  40.6 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0880  hypothetical protein  40.77 
 
 		 229 aa  123  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0751009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06060  conserved hypothetical protein TIGR03089  38.66 
 
 		 235 aa  122  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.100534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0938  hypothetical protein  40.34 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5904  hypothetical protein  35.61 
 
 		 321 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.638533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6350  hypothetical protein  39.38 
 
 		 230 aa  119  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.965008  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1060  hypothetical protein  35.19 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1851  hypothetical protein  36.68 
 
 		 237 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3868  hypothetical protein  39.58 
 
 		 243 aa  102  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  decreased coverage  0.0012235 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08510  conserved hypothetical protein TIGR03089  35.32 
 
 		 235 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.342847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2505  hypothetical protein  33.63 
 
 		 252 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2348  hypothetical protein  39.25 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0075811  hitchhiker  0.000005957 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09050  hypothetical protein  34.1 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.026099  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1262  hypothetical protein  38.62 
 
 		 242 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000677178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1191  hypothetical protein  38.04 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1862  hypothetical protein  30.67 
 
 		 255 aa  72  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.50666  hitchhiker  0.00495036 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2550  hypothetical protein  34.48 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1205  hypothetical protein  34.18 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4213  hypothetical protein  32.53 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal  0.28556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1692  AMP-dependent synthetase and ligase  28.4 
 
 		 560 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0924914  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20810  hypothetical protein  40.32 
 
 		 236 aa  49.3  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193012  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05260  hypothetical protein  41.12 
 
 		 217 aa  48.1  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.571136  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  42.03 
 
 		 4165 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2123  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 		 572 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.500205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02430  acetyl-coenzyme A synthetase  32.47 
 
 		 734 aa  42.7  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3322  AMP-dependent synthetase and ligase  25.51 
 
 		 532 aa  42.7  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000803182  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  31.43 
 
 		 555 aa  42.7  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2156  AMP-dependent synthetase and ligase  27.17 
 
 		 575 aa  42.7  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 552 aa  42.4  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>