36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1725 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1725  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  463  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4738  hypothetical protein  85.11 
 
 
244 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715967  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1317  hypothetical protein  72.03 
 
 
243 aa  329  3e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1334  hypothetical protein  72.03 
 
 
243 aa  329  3e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453667  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1353  hypothetical protein  72.03 
 
 
243 aa  329  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13297  hypothetical protein  70.18 
 
 
229 aa  313  9.999999999999999e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000791055  normal  0.907531 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1060  hypothetical protein  48.03 
 
 
228 aa  205  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06060  conserved hypothetical protein TIGR03089  45.73 
 
 
235 aa  168  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.100534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1851  hypothetical protein  45.66 
 
 
237 aa  159  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6350  hypothetical protein  43.83 
 
 
230 aa  155  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.965008  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0938  hypothetical protein  45.06 
 
 
229 aa  149  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0880  hypothetical protein  46.22 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0751009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7617  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  40.34 
 
 
298 aa  138  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4336  hypothetical protein  40.77 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00845407  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0710  hypothetical protein  37.35 
 
 
301 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.668983 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4095  hypothetical protein  35.07 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3777  AMP-dependent synthetase and ligase  38.49 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5904  hypothetical protein  34.73 
 
 
321 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.638533 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2525  hypothetical protein  35.68 
 
 
390 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376562  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3868  hypothetical protein  43.48 
 
 
243 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  decreased coverage  0.0012235 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2550  hypothetical protein  34.66 
 
 
245 aa  89.7  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1262  hypothetical protein  36.87 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000677178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1191  hypothetical protein  36.54 
 
 
261 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09050  hypothetical protein  32.81 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.026099  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2505  hypothetical protein  31.4 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1024  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08510  conserved hypothetical protein TIGR03089  36.84 
 
 
235 aa  80.5  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.342847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4213  hypothetical protein  35.8 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal  0.28556 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2348  hypothetical protein  50 
 
 
244 aa  75.1  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0075811  hitchhiker  0.000005957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1406  hypothetical protein  30.49 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1205  hypothetical protein  32.24 
 
 
252 aa  59.3  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1862  hypothetical protein  28.51 
 
 
255 aa  55.8  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.50666  hitchhiker  0.00495036 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05260  hypothetical protein  45.83 
 
 
217 aa  53.1  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.571136  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20810  hypothetical protein  44.44 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193012  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  42.35 
 
 
525 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1692  AMP-dependent synthetase and ligase  40.62 
 
 
560 aa  45.1  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0924914  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3955  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 
508 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>