37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0408 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0408  protein of unknown function DUF1622  100 
 
 		 123 aa  238  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1317  hypothetical protein  69.3 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306144  normal  0.351032 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0949  protein of unknown function DUF1622  70.34 
 
 		 119 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229976  normal  0.502302 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0901  hypothetical protein  60.5 
 
 		 135 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2740  protein of unknown function DUF1622  64.55 
 
 		 300 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0144  hypothetical protein  64 
 
 		 137 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2465  hypothetical protein  45.95 
 
 		 134 aa  97.4  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.266004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2337  hypothetical protein  48.48 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1563  hypothetical protein  60.61 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1082  protein of unknown function DUF1622  64.18 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2808  protein of unknown function DUF1622  46.02 
 
 		 136 aa  89.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.500646  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1404  hypothetical protein  57.58 
 
 		 79 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0065  hypothetical protein  42.02 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3393  protein of unknown function DUF1622  53.26 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000491801  hitchhiker  0.00000738542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1490  hypothetical protein  46.02 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1296  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3972  hypothetical protein  40.78 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2424  hypothetical protein  39.81 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.0636828 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1187  hypothetical protein  34.02 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000551521  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1773  protein of unknown function DUF1622  45.05 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2412  hypothetical protein  39.42 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2563  hypothetical protein  37.5 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394513  decreased coverage  0.00000227109 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2954  hypothetical protein  52.73 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2152  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2198  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.405596  normal  0.0269502 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2332  hypothetical protein  35.96 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2139  hypothetical protein  42.72 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00104938 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1730  protein of unknown function DUF1622  49.09 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1200  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.459956 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0493  hypothetical protein  43.86 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0701245  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4214  protein of unknown function DUF1622  39.36 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.738281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2686  protein of unknown function DUF1622  32.94 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1403  hypothetical protein  30.23 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.205259  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4064  protein of unknown function DUF1622  38.1 
 
 		 118 aa  43.5  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00544086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4026  protein of unknown function DUF1622  38.1 
 
 		 118 aa  43.5  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6943  protein of unknown function DUF1622  38.2 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4911  protein of unknown function DUF1622  29.25 
 
 		 123 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.646157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>