38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2412 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2412  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  269  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2563  hypothetical protein  82.17 
 
 		 136 aa  212  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394513  decreased coverage  0.00000227109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1773  protein of unknown function DUF1622  62.61 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1490  hypothetical protein  58.47 
 
 		 130 aa  134  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2424  hypothetical protein  52.1 
 
 		 134 aa  120  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.0636828 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3972  hypothetical protein  49.6 
 
 		 141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2152  hypothetical protein  54.92 
 
 		 136 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2198  hypothetical protein  54.92 
 
 		 136 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.405596  normal  0.0269502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2139  hypothetical protein  55.46 
 
 		 136 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00104938 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1200  hypothetical protein  44.8 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.459956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4911  protein of unknown function DUF1622  41.35 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.646157 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1328  hypothetical protein  50 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4064  protein of unknown function DUF1622  39.29 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00544086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4026  protein of unknown function DUF1622  39.29 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6943  protein of unknown function DUF1622  40.16 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2954  hypothetical protein  46.38 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1403  hypothetical protein  40.7 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.205259  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1187  hypothetical protein  28.16 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000551521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2686  protein of unknown function DUF1622  32.43 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2465  hypothetical protein  38.46 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.266004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4214  protein of unknown function DUF1622  46.46 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.738281 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1296  hypothetical protein  36.45 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2337  hypothetical protein  41.67 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0065  hypothetical protein  33.98 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2740  protein of unknown function DUF1622  36.84 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1186  hypothetical protein  27.36 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212975  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0493  hypothetical protein  29.91 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0701245  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2332  hypothetical protein  36.78 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1317  hypothetical protein  41.3 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306144  normal  0.351032 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0949  protein of unknown function DUF1622  46.88 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229976  normal  0.502302 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1730  protein of unknown function DUF1622  41.67 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2808  protein of unknown function DUF1622  34.31 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.500646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2050  hypothetical protein  29.73 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0408  protein of unknown function DUF1622  45 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2462  hypothetical protein  27.27 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0901  hypothetical protein  35.09 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1563  hypothetical protein  42.37 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2051  hypothetical protein  30.77 
 
 		 110 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.491141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>