33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0949 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0949  protein of unknown function DUF1622  100 
 
 
119 aa  230  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229976  normal  0.502302 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1317  hypothetical protein  70.18 
 
 
122 aa  147  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306144  normal  0.351032 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0408  protein of unknown function DUF1622  70.34 
 
 
123 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0901  hypothetical protein  59.66 
 
 
135 aa  130  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2740  protein of unknown function DUF1622  65.38 
 
 
300 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2337  hypothetical protein  54.55 
 
 
155 aa  103  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2465  hypothetical protein  52 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.266004 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1563  hypothetical protein  51.81 
 
 
114 aa  95.9  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0144  hypothetical protein  64.18 
 
 
137 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1082  protein of unknown function DUF1622  57.14 
 
 
137 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1404  hypothetical protein  57.14 
 
 
79 aa  85.5  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2808  protein of unknown function DUF1622  44.14 
 
 
136 aa  80.1  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.500646  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0065  hypothetical protein  44.95 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3393  protein of unknown function DUF1622  46.15 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000491801  hitchhiker  0.00000738542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1296  hypothetical protein  37.74 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1490  hypothetical protein  40.34 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1773  protein of unknown function DUF1622  42.59 
 
 
130 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2563  hypothetical protein  41.67 
 
 
136 aa  60.5  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394513  decreased coverage  0.00000227109 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3972  hypothetical protein  38.46 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2412  hypothetical protein  40.59 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45762  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2424  hypothetical protein  38.46 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.0636828 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1187  hypothetical protein  32.08 
 
 
114 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000551521  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2152  hypothetical protein  45.45 
 
 
136 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2198  hypothetical protein  45.45 
 
 
136 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.405596  normal  0.0269502 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2954  hypothetical protein  48.21 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2139  hypothetical protein  43.94 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00104938 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1730  protein of unknown function DUF1622  45.31 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4214  protein of unknown function DUF1622  37.21 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.738281 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6943  protein of unknown function DUF1622  35.48 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4026  protein of unknown function DUF1622  40 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4064  protein of unknown function DUF1622  40 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00544086  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2332  hypothetical protein  35.56 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1200  hypothetical protein  36.59 
 
 
138 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.459956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>