33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2808 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2808  protein of unknown function DUF1622  100 
 
 		 136 aa  260  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.500646  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1317  hypothetical protein  42.24 
 
 		 122 aa  90.9  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306144  normal  0.351032 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2740  protein of unknown function DUF1622  50 
 
 		 300 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0901  hypothetical protein  41.88 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3393  protein of unknown function DUF1622  46.03 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000491801  hitchhiker  0.00000738542 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2337  hypothetical protein  40 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0408  protein of unknown function DUF1622  57.35 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0065  hypothetical protein  40.57 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0949  protein of unknown function DUF1622  52.94 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229976  normal  0.502302 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0144  hypothetical protein  51.47 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1082  protein of unknown function DUF1622  49.28 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2465  hypothetical protein  44.78 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.266004 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1563  hypothetical protein  43.84 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1187  hypothetical protein  41.57 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000551521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1296  hypothetical protein  40.82 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1404  hypothetical protein  41.67 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1730  protein of unknown function DUF1622  40.58 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1490  hypothetical protein  38.89 
 
 		 130 aa  50.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2424  hypothetical protein  35.58 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.0636828 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1328  hypothetical protein  31.96 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3972  hypothetical protein  35.58 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2412  hypothetical protein  34.31 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1186  hypothetical protein  35 
 
 		 122 aa  47.8  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212975  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1773  protein of unknown function DUF1622  35.16 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2332  hypothetical protein  33.94 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2954  hypothetical protein  46.43 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2563  hypothetical protein  31.37 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394513  decreased coverage  0.00000227109 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2198  hypothetical protein  37.5 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.405596  normal  0.0269502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2152  hypothetical protein  37.5 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2686  protein of unknown function DUF1622  29.67 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2139  hypothetical protein  36.25 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00104938 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1403  hypothetical protein  30.43 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.205259  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4911  protein of unknown function DUF1622  30.85 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.646157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>