18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1404 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1404  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  157  7e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1563  hypothetical protein  84.29 
 
 		 114 aa  124  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0949  protein of unknown function DUF1622  57.14 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229976  normal  0.502302 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1317  hypothetical protein  56.58 
 
 		 122 aa  84.3  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306144  normal  0.351032 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0408  protein of unknown function DUF1622  57.58 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0901  hypothetical protein  61.54 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2465  hypothetical protein  47.95 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.266004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2337  hypothetical protein  48.65 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2740  protein of unknown function DUF1622  53.03 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0144  hypothetical protein  45.33 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1082  protein of unknown function DUF1622  42.31 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2808  protein of unknown function DUF1622  41.67 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.500646  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0065  hypothetical protein  48 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3393  protein of unknown function DUF1622  52.94 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000491801  hitchhiker  0.00000738542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1490  hypothetical protein  44.12 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3972  hypothetical protein  39.66 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1187  hypothetical protein  33.87 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000551521  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1730  protein of unknown function DUF1622  41.67 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>