29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1563 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1563  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  223  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1404  hypothetical protein  84.29 
 
 		 79 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0949  protein of unknown function DUF1622  51.81 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229976  normal  0.502302 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0901  hypothetical protein  45.38 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1317  hypothetical protein  43.64 
 
 		 122 aa  93.6  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306144  normal  0.351032 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2740  protein of unknown function DUF1622  48.98 
 
 		 300 aa  90.9  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0408  protein of unknown function DUF1622  57.97 
 
 		 123 aa  90.9  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2337  hypothetical protein  39.8 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2465  hypothetical protein  36.73 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.266004 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0144  hypothetical protein  46.27 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2808  protein of unknown function DUF1622  35.19 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.500646  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0065  hypothetical protein  40.54 
 
 		 119 aa  67  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1082  protein of unknown function DUF1622  42.65 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3393  protein of unknown function DUF1622  42.73 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000491801  hitchhiker  0.00000738542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1490  hypothetical protein  33.63 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3972  hypothetical protein  33.01 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1296  hypothetical protein  32.35 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1187  hypothetical protein  31.96 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000551521  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2424  hypothetical protein  31.68 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.0636828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2412  hypothetical protein  32 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1773  protein of unknown function DUF1622  33.71 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2563  hypothetical protein  30.77 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394513  decreased coverage  0.00000227109 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1730  protein of unknown function DUF1622  43.64 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1403  hypothetical protein  28.43 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.205259  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2332  hypothetical protein  37.68 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1405  hypothetical protein  64.52 
 
 		 42 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2198  hypothetical protein  41.38 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.405596  normal  0.0269502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2152  hypothetical protein  41.38 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2954  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>