33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0901 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0901  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  266  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1317  hypothetical protein  58.2 
 
 
122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306144  normal  0.351032 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2740  protein of unknown function DUF1622  52.34 
 
 
300 aa  114  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0408  protein of unknown function DUF1622  59.66 
 
 
123 aa  110  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0949  protein of unknown function DUF1622  60.17 
 
 
119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229976  normal  0.502302 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0144  hypothetical protein  60.81 
 
 
137 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1082  protein of unknown function DUF1622  57.75 
 
 
137 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1563  hypothetical protein  63.08 
 
 
114 aa  87  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2465  hypothetical protein  41.03 
 
 
134 aa  84.7  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.266004 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1404  hypothetical protein  58.11 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2337  hypothetical protein  52.56 
 
 
155 aa  84  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2808  protein of unknown function DUF1622  41.03 
 
 
136 aa  83.2  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.500646  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0065  hypothetical protein  42.86 
 
 
119 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3393  protein of unknown function DUF1622  60.61 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000491801  hitchhiker  0.00000738542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3972  hypothetical protein  35.51 
 
 
141 aa  62  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2424  hypothetical protein  34.58 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.0636828 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1296  hypothetical protein  35.58 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1187  hypothetical protein  32.14 
 
 
114 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000551521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1490  hypothetical protein  33.05 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2152  hypothetical protein  39.74 
 
 
136 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1730  protein of unknown function DUF1622  51.72 
 
 
110 aa  51.6  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2198  hypothetical protein  39.74 
 
 
136 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.405596  normal  0.0269502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2139  hypothetical protein  38.46 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00104938 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2954  hypothetical protein  50.85 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2412  hypothetical protein  33.58 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45762  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1773  protein of unknown function DUF1622  37.11 
 
 
130 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1200  hypothetical protein  45.16 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.459956 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4064  protein of unknown function DUF1622  33.75 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00544086  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4026  protein of unknown function DUF1622  33.75 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2332  hypothetical protein  40.68 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2563  hypothetical protein  33.64 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394513  decreased coverage  0.00000227109 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6943  protein of unknown function DUF1622  48.44 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4214  protein of unknown function DUF1622  44.29 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.738281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>