33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6943 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013732  Slin_6943  protein of unknown function DUF1622  100 
 
 
128 aa  250  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4214  protein of unknown function DUF1622  77.6 
 
 
125 aa  160  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.738281 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1200  hypothetical protein  46.46 
 
 
138 aa  86.7  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.459956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1490  hypothetical protein  43.59 
 
 
130 aa  83.6  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2563  hypothetical protein  40.31 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394513  decreased coverage  0.00000227109 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3972  hypothetical protein  37.7 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2412  hypothetical protein  39.84 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45762  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2424  hypothetical protein  39.29 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.0636828 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2198  hypothetical protein  50.68 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.405596  normal  0.0269502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2152  hypothetical protein  50.68 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2139  hypothetical protein  49.32 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00104938 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1773  protein of unknown function DUF1622  44.79 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4911  protein of unknown function DUF1622  45.33 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.646157 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4064  protein of unknown function DUF1622  50 
 
 
118 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00544086  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4026  protein of unknown function DUF1622  50 
 
 
118 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1403  hypothetical protein  50.88 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.205259  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2686  protein of unknown function DUF1622  46.97 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1328  hypothetical protein  47.62 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1296  hypothetical protein  32.61 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2954  hypothetical protein  36.49 
 
 
124 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0949  protein of unknown function DUF1622  40.54 
 
 
119 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229976  normal  0.502302 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0901  hypothetical protein  48.44 
 
 
135 aa  50.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1187  hypothetical protein  38.36 
 
 
114 aa  50.8  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000551521  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0408  protein of unknown function DUF1622  51.85 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1730  protein of unknown function DUF1622  34.85 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2462  hypothetical protein  35.09 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1317  hypothetical protein  33 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306144  normal  0.351032 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2051  hypothetical protein  30.21 
 
 
110 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0493  hypothetical protein  42.59 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0701245  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0144  hypothetical protein  39.24 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1199  hypothetical protein  44.07 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.452681 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1082  protein of unknown function DUF1622  41.67 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2332  hypothetical protein  31.75 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>