27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2686 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2686  protein of unknown function DUF1622  100 
 
 
135 aa  271  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1403  hypothetical protein  56.7 
 
 
111 aa  106  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.205259  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1200  hypothetical protein  45.33 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.459956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2412  hypothetical protein  32.43 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45762  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2563  hypothetical protein  29.84 
 
 
136 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394513  decreased coverage  0.00000227109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1773  protein of unknown function DUF1622  27.88 
 
 
130 aa  61.6  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4214  protein of unknown function DUF1622  40.66 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.738281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2424  hypothetical protein  33.64 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.0636828 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1296  hypothetical protein  34.44 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2198  hypothetical protein  40 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.405596  normal  0.0269502 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3972  hypothetical protein  33.65 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2152  hypothetical protein  40 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1490  hypothetical protein  40 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6943  protein of unknown function DUF1622  46.97 
 
 
128 aa  57  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2139  hypothetical protein  38.33 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00104938 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4026  protein of unknown function DUF1622  32.69 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4064  protein of unknown function DUF1622  32.69 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00544086  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2954  hypothetical protein  46.94 
 
 
124 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4911  protein of unknown function DUF1622  31.03 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.646157 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1187  hypothetical protein  41.07 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000551521  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1317  hypothetical protein  27.55 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306144  normal  0.351032 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1328  hypothetical protein  29.59 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0408  protein of unknown function DUF1622  32.93 
 
 
123 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2808  protein of unknown function DUF1622  29.67 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.500646  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2337  hypothetical protein  29.47 
 
 
155 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0493  hypothetical protein  34.92 
 
 
111 aa  41.2  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0701245  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1186  hypothetical protein  28.7 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>