39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1490 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1490  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  242  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3972  hypothetical protein  65.18 
 
 
141 aa  141  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2424  hypothetical protein  60.63 
 
 
134 aa  141  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.0636828 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2563  hypothetical protein  60.16 
 
 
136 aa  135  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394513  decreased coverage  0.00000227109 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2412  hypothetical protein  58.47 
 
 
136 aa  134  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45762  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2152  hypothetical protein  67.97 
 
 
136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2198  hypothetical protein  67.97 
 
 
136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.405596  normal  0.0269502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2139  hypothetical protein  67.19 
 
 
136 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00104938 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1773  protein of unknown function DUF1622  64.49 
 
 
130 aa  124  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4911  protein of unknown function DUF1622  38.53 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.646157 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1200  hypothetical protein  57.81 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.459956 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4026  protein of unknown function DUF1622  38.78 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4064  protein of unknown function DUF1622  38.78 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00544086  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1317  hypothetical protein  44.86 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306144  normal  0.351032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1296  hypothetical protein  35.51 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6943  protein of unknown function DUF1622  43.59 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4214  protein of unknown function DUF1622  43.8 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.738281 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1328  hypothetical protein  53.23 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1403  hypothetical protein  34.91 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.205259  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2740  protein of unknown function DUF1622  41.59 
 
 
300 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2954  hypothetical protein  46.03 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2462  hypothetical protein  32.74 
 
 
115 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2686  protein of unknown function DUF1622  40 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0408  protein of unknown function DUF1622  52.11 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0901  hypothetical protein  33.05 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0065  hypothetical protein  31.3 
 
 
119 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1187  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000551521  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0949  protein of unknown function DUF1622  47.14 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229976  normal  0.502302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1082  protein of unknown function DUF1622  43.02 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0144  hypothetical protein  46.25 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2808  protein of unknown function DUF1622  38.89 
 
 
136 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.500646  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2337  hypothetical protein  34.35 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2465  hypothetical protein  33.65 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.266004 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1730  protein of unknown function DUF1622  37.29 
 
 
110 aa  47  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2332  hypothetical protein  35.29 
 
 
110 aa  47  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1186  hypothetical protein  21.5 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212975  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0493  hypothetical protein  26 
 
 
111 aa  45.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0701245  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1563  hypothetical protein  31.86 
 
 
114 aa  43.9  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1404  hypothetical protein  44.12 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>