34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2337 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2337  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  303  5.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2465  hypothetical protein  70.68 
 
 
134 aa  181  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.266004 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1317  hypothetical protein  54.08 
 
 
122 aa  105  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306144  normal  0.351032 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0949  protein of unknown function DUF1622  58.33 
 
 
119 aa  97.8  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229976  normal  0.502302 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2740  protein of unknown function DUF1622  42.37 
 
 
300 aa  93.6  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0408  protein of unknown function DUF1622  57.58 
 
 
123 aa  84.3  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2808  protein of unknown function DUF1622  40 
 
 
136 aa  82  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.500646  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0901  hypothetical protein  57.58 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0144  hypothetical protein  54.55 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1404  hypothetical protein  48.65 
 
 
79 aa  79.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1563  hypothetical protein  51.52 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1082  protein of unknown function DUF1622  42.7 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0065  hypothetical protein  39.25 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2332  hypothetical protein  38.83 
 
 
110 aa  60.8  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2412  hypothetical protein  41.67 
 
 
136 aa  60.5  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45762  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2563  hypothetical protein  41.67 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394513  decreased coverage  0.00000227109 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2051  hypothetical protein  36.04 
 
 
110 aa  57.4  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1296  hypothetical protein  33.64 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3393  protein of unknown function DUF1622  41.51 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000491801  hitchhiker  0.00000738542 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1187  hypothetical protein  39.73 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000551521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1490  hypothetical protein  34.35 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3972  hypothetical protein  31.19 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2424  hypothetical protein  33.68 
 
 
134 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.0636828 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1730  protein of unknown function DUF1622  43.64 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1773  protein of unknown function DUF1622  34.83 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0493  hypothetical protein  30.77 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0701245  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1186  hypothetical protein  30.56 
 
 
122 aa  44.3  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212975  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2198  hypothetical protein  37.36 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.405596  normal  0.0269502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2152  hypothetical protein  37.36 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4911  protein of unknown function DUF1622  27.88 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.646157 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2954  hypothetical protein  36 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2139  hypothetical protein  36.26 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00104938 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2050  hypothetical protein  39.06 
 
 
119 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2686  protein of unknown function DUF1622  29.47 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>