30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3393 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3393  protein of unknown function DUF1622  100 
 
 		 138 aa  268  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000491801  hitchhiker  0.00000738542 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2808  protein of unknown function DUF1622  46.03 
 
 		 136 aa  113  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.500646  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1317  hypothetical protein  47.32 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306144  normal  0.351032 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0408  protein of unknown function DUF1622  53.26 
 
 		 123 aa  92  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0901  hypothetical protein  45.3 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2740  protein of unknown function DUF1622  47.27 
 
 		 300 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0949  protein of unknown function DUF1622  55.26 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229976  normal  0.502302 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1563  hypothetical protein  42.73 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2337  hypothetical protein  39.06 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1082  protein of unknown function DUF1622  41.49 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0144  hypothetical protein  50.65 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0065  hypothetical protein  43.12 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1404  hypothetical protein  52.94 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2465  hypothetical protein  46.48 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.266004 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1296  hypothetical protein  34.29 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1490  hypothetical protein  35.38 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2332  hypothetical protein  40.3 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1187  hypothetical protein  42.86 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000551521  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1773  protein of unknown function DUF1622  37.08 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2051  hypothetical protein  31.68 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1730  protein of unknown function DUF1622  44.64 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2412  hypothetical protein  34 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2954  hypothetical protein  46.43 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2424  hypothetical protein  32 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.0636828 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3972  hypothetical protein  32 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2563  hypothetical protein  32 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394513  decreased coverage  0.00000227109 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2198  hypothetical protein  39.39 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.405596  normal  0.0269502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2152  hypothetical protein  39.39 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2139  hypothetical protein  37.88 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00104938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4911  protein of unknown function DUF1622  32.04 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.646157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>