32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2740 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2740  protein of unknown function DUF1622  100 
 
 		 300 aa  594  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2005  Vitamin K epoxide reductase  52.76 
 
 		 166 aa  149  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00854012  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0633  vitamin K epoxide reductase  41.46 
 
 		 175 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1317  hypothetical protein  65.77 
 
 		 122 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306144  normal  0.351032 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1846  vitamin K epoxide reductase  39.53 
 
 		 171 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.932488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0901  hypothetical protein  55.65 
 
 		 135 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0408  protein of unknown function DUF1622  66.67 
 
 		 123 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0949  protein of unknown function DUF1622  66.67 
 
 		 119 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229976  normal  0.502302 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2465  hypothetical protein  43.81 
 
 		 134 aa  94  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.266004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2337  hypothetical protein  42.37 
 
 		 155 aa  93.6  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0144  hypothetical protein  60.53 
 
 		 137 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2808  protein of unknown function DUF1622  50 
 
 		 136 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.500646  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1082  protein of unknown function DUF1622  61.76 
 
 		 137 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0065  hypothetical protein  47.57 
 
 		 119 aa  83.6  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1563  hypothetical protein  56.06 
 
 		 114 aa  80.5  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1404  hypothetical protein  53.03 
 
 		 79 aa  76.6  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3393  protein of unknown function DUF1622  55.41 
 
 		 138 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000491801  hitchhiker  0.00000738542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1490  hypothetical protein  41.59 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3972  hypothetical protein  38.46 
 
 		 141 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2424  hypothetical protein  36.54 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.0636828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2412  hypothetical protein  36.84 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2563  hypothetical protein  32.8 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394513  decreased coverage  0.00000227109 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1187  hypothetical protein  35.05 
 
 		 114 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000551521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1296  hypothetical protein  35.19 
 
 		 111 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1773  protein of unknown function DUF1622  44.94 
 
 		 130 aa  53.9  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1730  protein of unknown function DUF1622  51.79 
 
 		 110 aa  52.4  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1186  hypothetical protein  33.7 
 
 		 122 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212975  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1328  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  46.2  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2050  hypothetical protein  35.96 
 
 		 119 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2954  hypothetical protein  48.21 
 
 		 124 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4911  protein of unknown function DUF1622  38.3 
 
 		 123 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.646157 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2332  hypothetical protein  40.3 
 
 		 110 aa  42.7  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>