36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1730 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1730  protein of unknown function DUF1622  100 
 
 
110 aa  217  3.9999999999999997e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1187  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000551521  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1186  hypothetical protein  43.81 
 
 
122 aa  77  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212975  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1296  hypothetical protein  35.92 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0493  hypothetical protein  35.29 
 
 
111 aa  60.5  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0701245  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2740  protein of unknown function DUF1622  39.33 
 
 
300 aa  57.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0901  hypothetical protein  36.54 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2332  hypothetical protein  32.35 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2050  hypothetical protein  41.57 
 
 
119 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1403  hypothetical protein  34.62 
 
 
111 aa  55.1  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.205259  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2954  hypothetical protein  41.54 
 
 
124 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3972  hypothetical protein  31.31 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1317  hypothetical protein  36.73 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306144  normal  0.351032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2424  hypothetical protein  33.68 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.0636828 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1200  hypothetical protein  34.29 
 
 
138 aa  51.2  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.459956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1773  protein of unknown function DUF1622  40 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2808  protein of unknown function DUF1622  39.44 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.500646  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0408  protein of unknown function DUF1622  42.67 
 
 
123 aa  50.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2337  hypothetical protein  31.25 
 
 
155 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2051  hypothetical protein  41.79 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2412  hypothetical protein  41.67 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45762  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2465  hypothetical protein  45.45 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.266004 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2198  hypothetical protein  40.68 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.405596  normal  0.0269502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2152  hypothetical protein  40.68 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1490  hypothetical protein  37.29 
 
 
130 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0949  protein of unknown function DUF1622  43.48 
 
 
119 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229976  normal  0.502302 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0144  hypothetical protein  50.91 
 
 
137 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2139  hypothetical protein  40.68 
 
 
136 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00104938 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2563  hypothetical protein  40 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394513  decreased coverage  0.00000227109 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4911  protein of unknown function DUF1622  28.87 
 
 
123 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.646157 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1563  hypothetical protein  37.21 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1082  protein of unknown function DUF1622  51.92 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0065  hypothetical protein  39.25 
 
 
119 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4026  protein of unknown function DUF1622  28.16 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4064  protein of unknown function DUF1622  28.16 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00544086  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1328  hypothetical protein  28.75 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>