30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1403 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1403  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  219  9.999999999999999e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.205259  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2686  protein of unknown function DUF1622  56.7 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1200  hypothetical protein  39.56 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.459956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1773  protein of unknown function DUF1622  37.89 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1296  hypothetical protein  33.01 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4214  protein of unknown function DUF1622  36.73 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.738281 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2412  hypothetical protein  40.7 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1490  hypothetical protein  34.91 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2152  hypothetical protein  50.91 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2198  hypothetical protein  50.91 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.405596  normal  0.0269502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2139  hypothetical protein  49.09 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00104938 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2563  hypothetical protein  38.2 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394513  decreased coverage  0.00000227109 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3972  hypothetical protein  32.35 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6943  protein of unknown function DUF1622  50.88 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2424  hypothetical protein  38.37 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.0636828 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2954  hypothetical protein  40.68 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4911  protein of unknown function DUF1622  35.87 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.646157 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4026  protein of unknown function DUF1622  32.32 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4064  protein of unknown function DUF1622  32.32 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00544086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2050  hypothetical protein  35 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0493  hypothetical protein  32.35 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0701245  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1187  hypothetical protein  37.33 
 
 		 114 aa  47.4  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000551521  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1730  protein of unknown function DUF1622  47.83 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1186  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212975  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2332  hypothetical protein  26.42 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1317  hypothetical protein  28.42 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306144  normal  0.351032 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1328  hypothetical protein  29.79 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2051  hypothetical protein  31.96 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2808  protein of unknown function DUF1622  30.43 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.500646  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0408  protein of unknown function DUF1622  33.33 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>