21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2051 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2051  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  212  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2050  hypothetical protein  56.38 
 
 
119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0493  hypothetical protein  44.23 
 
 
111 aa  97.4  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0701245  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2332  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2337  hypothetical protein  36.04 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1187  hypothetical protein  36.56 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000551521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1296  hypothetical protein  33.64 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4911  protein of unknown function DUF1622  32.95 
 
 
123 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.646157 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1730  protein of unknown function DUF1622  41.79 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1186  hypothetical protein  44.23 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212975  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4064  protein of unknown function DUF1622  35.87 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00544086  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4026  protein of unknown function DUF1622  35.87 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2465  hypothetical protein  32.69 
 
 
134 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.266004 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1328  hypothetical protein  31.11 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4214  protein of unknown function DUF1622  33.68 
 
 
125 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.738281 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1200  hypothetical protein  31.25 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.459956 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1403  hypothetical protein  31.96 
 
 
111 aa  43.9  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.205259  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2954  hypothetical protein  33.93 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3972  hypothetical protein  21 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2424  hypothetical protein  22 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.0636828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2412  hypothetical protein  30.77 
 
 
136 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45762  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>