35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1317 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1317  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  235  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306144  normal  0.351032 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2740  protein of unknown function DUF1622  65.77 
 
 
300 aa  130  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0901  hypothetical protein  58.82 
 
 
135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0949  protein of unknown function DUF1622  70.18 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229976  normal  0.502302 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0408  protein of unknown function DUF1622  69.3 
 
 
123 aa  125  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2337  hypothetical protein  54.08 
 
 
155 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2465  hypothetical protein  51.52 
 
 
134 aa  100  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.266004 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0144  hypothetical protein  52.13 
 
 
137 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1082  protein of unknown function DUF1622  50 
 
 
137 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0065  hypothetical protein  47.27 
 
 
119 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2808  protein of unknown function DUF1622  42.24 
 
 
136 aa  90.9  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.500646  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1563  hypothetical protein  48.81 
 
 
114 aa  87.8  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1404  hypothetical protein  56.58 
 
 
79 aa  84.3  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1490  hypothetical protein  44.86 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3393  protein of unknown function DUF1622  47.32 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000491801  hitchhiker  0.00000738542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3972  hypothetical protein  36.61 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1187  hypothetical protein  34.86 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000551521  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2424  hypothetical protein  38.74 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.0636828 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1773  protein of unknown function DUF1622  45.56 
 
 
130 aa  57  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1296  hypothetical protein  35.19 
 
 
111 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2412  hypothetical protein  41.3 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45762  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2563  hypothetical protein  42.22 
 
 
136 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394513  decreased coverage  0.00000227109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4026  protein of unknown function DUF1622  36.46 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4064  protein of unknown function DUF1622  36.46 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00544086  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2954  hypothetical protein  43.66 
 
 
124 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1730  protein of unknown function DUF1622  50.91 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2198  hypothetical protein  40 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.405596  normal  0.0269502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2152  hypothetical protein  40 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2139  hypothetical protein  44.83 
 
 
136 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00104938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2686  protein of unknown function DUF1622  27.55 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1403  hypothetical protein  28.42 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.205259  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2332  hypothetical protein  36.54 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1200  hypothetical protein  45.95 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.459956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4911  protein of unknown function DUF1622  32.32 
 
 
123 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.646157 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1328  hypothetical protein  33.96 
 
 
130 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>