43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2174 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2174  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  799    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00796249  hitchhiker  0.00000589334 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1889  hypothetical protein  40.1 
 
 		 432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0494  hypothetical protein  33.49 
 
 		 432 aa  190  4e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0701  hypothetical protein  33.93 
 
 		 436 aa  184  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1802  hypothetical protein  39.32 
 
 		 499 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2816  hypothetical protein  40.78 
 
 		 456 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2753  hypothetical protein  40.89 
 
 		 438 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1707  hypothetical protein  40.52 
 
 		 466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2894  hypothetical protein  40.52 
 
 		 466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2393  hypothetical protein  40.52 
 
 		 466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0620  hypothetical protein  40.62 
 
 		 438 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2696  hypothetical protein  40.52 
 
 		 466 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0998  hypothetical protein  41.19 
 
 		 432 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1647  hypothetical protein  37.5 
 
 		 451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3588  hypothetical protein  32.53 
 
 		 427 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4665  putative transmembrane protein  32.53 
 
 		 427 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2114  putative transmembrane protein  32.55 
 
 		 426 aa  93.6  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.868258  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1790  hypothetical protein  31.12 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0467  hypothetical protein  23.71 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000668675  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6282  hypothetical protein  29.09 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.454076  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_003296  RS02303  hypothetical protein  34.02 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0267  hypothetical protein  30.53 
 
 		 386 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2084  hypothetical protein  36.29 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.506799 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0347  hypothetical protein  25.07 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0120833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5063  hypothetical protein  32.86 
 
 		 462 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0794  hypothetical protein  24.34 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1160  hypothetical protein  30.3 
 
 		 463 aa  75.5  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.300381 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4376  hypothetical protein  28.61 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0700  hypothetical protein  25.72 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.694234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0901  hypothetical protein  30.41 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1635  peptidase M50  24.06 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1841  hypothetical protein  25.93 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0686029  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1436  hypothetical protein  23.71 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0173  hypothetical protein  29.32 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293507  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1722  hypothetical protein  28.82 
 
 		 460 aa  57  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4283  hypothetical protein  27.71 
 
 		 451 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846286  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1977  hypothetical protein  28.28 
 
 		 434 aa  53.5  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0435007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1552  hypothetical protein  25.88 
 
 		 416 aa  53.1  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2153  hypothetical protein  31.16 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1457  hypothetical protein  28.42 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629081  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0253  hypothetical protein  27.94 
 
 		 455 aa  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.8172  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0229  hypothetical protein  27.94 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0560  hypothetical protein  21.61 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.174074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>