41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2153 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2153  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  826    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0347  hypothetical protein  26.32 
 
 
407 aa  103  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0120833  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1841  hypothetical protein  29.28 
 
 
393 aa  98.2  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0686029  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0173  hypothetical protein  31.52 
 
 
445 aa  96.7  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293507  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0794  hypothetical protein  27.84 
 
 
411 aa  95.1  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4376  hypothetical protein  28.37 
 
 
455 aa  87  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0467  hypothetical protein  23.42 
 
 
410 aa  86.7  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000668675  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1647  hypothetical protein  29.35 
 
 
451 aa  85.9  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605477  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0267  hypothetical protein  31.49 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1552  hypothetical protein  27.39 
 
 
416 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1436  hypothetical protein  29.04 
 
 
423 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0901  hypothetical protein  28.48 
 
 
408 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1635  peptidase M50  25.97 
 
 
396 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1160  hypothetical protein  30.89 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.300381 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0560  hypothetical protein  25 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.174074  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6282  hypothetical protein  28.5 
 
 
452 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.454076  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4283  hypothetical protein  27.97 
 
 
451 aa  71.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846286  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0700  hypothetical protein  28.21 
 
 
428 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.694234  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1722  hypothetical protein  27.91 
 
 
460 aa  67  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1457  hypothetical protein  27.59 
 
 
451 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629081  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0494  hypothetical protein  23.5 
 
 
432 aa  64.7  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2753  hypothetical protein  30 
 
 
438 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2816  hypothetical protein  30 
 
 
456 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2696  hypothetical protein  28.87 
 
 
466 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4665  putative transmembrane protein  31.62 
 
 
427 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3588  hypothetical protein  31.62 
 
 
427 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2174  hypothetical protein  29.71 
 
 
426 aa  60.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00796249  hitchhiker  0.00000589334 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1707  hypothetical protein  29 
 
 
466 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2894  hypothetical protein  29 
 
 
466 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2393  hypothetical protein  29 
 
 
466 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1977  hypothetical protein  29.89 
 
 
434 aa  60.5  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0435007  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0620  hypothetical protein  29 
 
 
438 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0253  hypothetical protein  32.12 
 
 
455 aa  58.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.8172  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0229  hypothetical protein  32.12 
 
 
428 aa  57.8  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2359  hypothetical protein  33.73 
 
 
425 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0701  hypothetical protein  24.81 
 
 
436 aa  51.2  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1889  hypothetical protein  29.28 
 
 
432 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1790  hypothetical protein  30 
 
 
426 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1536  hypothetical protein  26.61 
 
 
427 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1802  hypothetical protein  29.13 
 
 
499 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2114  putative transmembrane protein  29.55 
 
 
426 aa  43.9  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.868258  normal  0.68742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>