37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0901 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0901  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  769    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0267  hypothetical protein  34.48 
 
 
386 aa  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0700  hypothetical protein  31.31 
 
 
428 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.694234  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0794  hypothetical protein  25.59 
 
 
411 aa  87.4  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0173  hypothetical protein  28.94 
 
 
445 aa  82.8  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293507  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0347  hypothetical protein  22.79 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0120833  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1436  hypothetical protein  25.95 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1536  hypothetical protein  29.41 
 
 
427 aa  76.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0467  hypothetical protein  22.09 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000668675  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6282  hypothetical protein  29.38 
 
 
452 aa  67  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.454076  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4376  hypothetical protein  32.37 
 
 
455 aa  66.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2153  hypothetical protein  29.07 
 
 
434 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1160  hypothetical protein  27.51 
 
 
463 aa  60.8  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.300381 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1977  hypothetical protein  29.97 
 
 
434 aa  60.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0435007  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2174  hypothetical protein  32.1 
 
 
426 aa  60.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00796249  hitchhiker  0.00000589334 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1647  hypothetical protein  26.26 
 
 
451 aa  60.5  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605477  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0229  hypothetical protein  31.53 
 
 
428 aa  56.6  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0253  hypothetical protein  31.53 
 
 
455 aa  56.6  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.8172  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1552  hypothetical protein  29.17 
 
 
416 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1841  hypothetical protein  25.25 
 
 
393 aa  54.3  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0686029  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1457  hypothetical protein  26.72 
 
 
451 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629081  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1722  hypothetical protein  27.11 
 
 
460 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1790  hypothetical protein  30.31 
 
 
426 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2114  putative transmembrane protein  30 
 
 
426 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.868258  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4283  hypothetical protein  28.45 
 
 
451 aa  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846286  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1889  hypothetical protein  29.81 
 
 
432 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0560  hypothetical protein  23.38 
 
 
393 aa  47.4  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.174074  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4665  putative transmembrane protein  28.35 
 
 
427 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3588  hypothetical protein  28.35 
 
 
427 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2696  hypothetical protein  30.57 
 
 
466 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2753  hypothetical protein  30.05 
 
 
438 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2816  hypothetical protein  30.05 
 
 
456 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0620  hypothetical protein  30.05 
 
 
438 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1707  hypothetical protein  30.05 
 
 
466 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2894  hypothetical protein  30.05 
 
 
466 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2393  hypothetical protein  30.05 
 
 
466 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1272  hypothetical protein  21.17 
 
 
376 aa  43.5  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>