23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1790 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1790  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  796    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2114  putative transmembrane protein  97.42 
 
 		 426 aa  695    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.868258  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3588  hypothetical protein  75.06 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4665  putative transmembrane protein  75.06 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02303  hypothetical protein  73.22 
 
 		 406 aa  484  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2084  hypothetical protein  48.95 
 
 		 444 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.506799 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5063  hypothetical protein  49.06 
 
 		 462 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1889  hypothetical protein  29.87 
 
 		 432 aa  99.8  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0494  hypothetical protein  26.11 
 
 		 432 aa  87.8  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2174  hypothetical protein  34.33 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00796249  hitchhiker  0.00000589334 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1647  hypothetical protein  26.48 
 
 		 451 aa  70.1  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1802  hypothetical protein  28.72 
 
 		 499 aa  67  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2696  hypothetical protein  30.4 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2816  hypothetical protein  30.53 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2753  hypothetical protein  30.4 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1707  hypothetical protein  29.96 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2894  hypothetical protein  29.96 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2393  hypothetical protein  29.96 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0620  hypothetical protein  29.96 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0998  hypothetical protein  35.05 
 
 		 432 aa  59.7  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0901  hypothetical protein  30.72 
 
 		 408 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0701  hypothetical protein  22.44 
 
 		 436 aa  47.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0267  hypothetical protein  28.86 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>