27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0701 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0701  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  863    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0494  hypothetical protein  31.19 
 
 		 432 aa  169  6e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2174  hypothetical protein  33.94 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00796249  hitchhiker  0.00000589334 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1889  hypothetical protein  28.67 
 
 		 432 aa  143  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1647  hypothetical protein  30.45 
 
 		 451 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2696  hypothetical protein  29.62 
 
 		 466 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0620  hypothetical protein  29.7 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1707  hypothetical protein  29.7 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2393  hypothetical protein  29.7 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2894  hypothetical protein  29.7 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1802  hypothetical protein  28.57 
 
 		 499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2753  hypothetical protein  29.37 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2816  hypothetical protein  29.37 
 
 		 456 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0998  hypothetical protein  31.75 
 
 		 432 aa  97.1  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0700  hypothetical protein  26.29 
 
 		 428 aa  67  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.694234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4665  putative transmembrane protein  23.22 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3588  hypothetical protein  23.22 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4283  hypothetical protein  27.69 
 
 		 451 aa  54.3  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846286  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0467  hypothetical protein  24.41 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000668675  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4376  hypothetical protein  23.79 
 
 		 455 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1552  hypothetical protein  25.2 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6282  hypothetical protein  22.41 
 
 		 452 aa  46.6  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.454076  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_003296  RS02303  hypothetical protein  22.16 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1536  hypothetical protein  26.95 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0267  hypothetical protein  23.98 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0347  hypothetical protein  24.87 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0120833  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1790  hypothetical protein  22.07 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.666466 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>