36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4283 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4283  hypothetical protein  100 
 
 
451 aa  876    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846286  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4376  hypothetical protein  53.38 
 
 
455 aa  428  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1457  hypothetical protein  52.78 
 
 
451 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629081  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6282  hypothetical protein  51.11 
 
 
452 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.454076  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0253  hypothetical protein  51.46 
 
 
455 aa  348  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.8172  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0229  hypothetical protein  51.44 
 
 
428 aa  320  5e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1722  hypothetical protein  28.72 
 
 
460 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1647  hypothetical protein  26.3 
 
 
451 aa  80.1  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605477  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0173  hypothetical protein  29.75 
 
 
445 aa  74.7  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293507  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1977  hypothetical protein  29.01 
 
 
434 aa  71.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0435007  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2153  hypothetical protein  28.16 
 
 
434 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0794  hypothetical protein  23.95 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1160  hypothetical protein  27.18 
 
 
463 aa  65.1  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.300381 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1841  hypothetical protein  28.08 
 
 
393 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0686029  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2696  hypothetical protein  28.86 
 
 
466 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0700  hypothetical protein  25.56 
 
 
428 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.694234  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0467  hypothetical protein  21.89 
 
 
410 aa  63.2  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000668675  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1436  hypothetical protein  24.11 
 
 
423 aa  62  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2753  hypothetical protein  28.46 
 
 
438 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2816  hypothetical protein  28.46 
 
 
456 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0701  hypothetical protein  25.79 
 
 
436 aa  59.7  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0620  hypothetical protein  28.15 
 
 
438 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1707  hypothetical protein  28.15 
 
 
466 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2894  hypothetical protein  28.15 
 
 
466 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2393  hypothetical protein  28.15 
 
 
466 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0347  hypothetical protein  22.77 
 
 
407 aa  57.8  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0120833  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0901  hypothetical protein  27.59 
 
 
408 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1552  hypothetical protein  27.75 
 
 
416 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0494  hypothetical protein  25.35 
 
 
432 aa  54.7  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0560  hypothetical protein  26.5 
 
 
393 aa  51.6  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.174074  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0267  hypothetical protein  26.7 
 
 
386 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4665  putative transmembrane protein  29.06 
 
 
427 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3588  hypothetical protein  29.06 
 
 
427 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1802  hypothetical protein  26.69 
 
 
499 aa  47.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2174  hypothetical protein  26.72 
 
 
426 aa  47  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00796249  hitchhiker  0.00000589334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1536  hypothetical protein  28.27 
 
 
427 aa  43.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>