18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0560 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0560  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  751    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.174074  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1841  hypothetical protein  48.46 
 
 
393 aa  320  3e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0686029  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1635  peptidase M50  47.58 
 
 
396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1436  hypothetical protein  33.17 
 
 
423 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0347  hypothetical protein  32.4 
 
 
407 aa  133  6e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0120833  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0467  hypothetical protein  33.08 
 
 
410 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000668675  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0794  hypothetical protein  28.84 
 
 
411 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4376  hypothetical protein  23.71 
 
 
455 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0267  hypothetical protein  23.21 
 
 
386 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0700  hypothetical protein  24.66 
 
 
428 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.694234  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1647  hypothetical protein  26.09 
 
 
451 aa  50.1  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605477  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0494  hypothetical protein  24.86 
 
 
432 aa  50.4  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1552  hypothetical protein  27.47 
 
 
416 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6282  hypothetical protein  24.57 
 
 
452 aa  47  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.454076  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0998  hypothetical protein  23.63 
 
 
432 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0253  hypothetical protein  25.51 
 
 
455 aa  44.3  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.8172  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0229  hypothetical protein  25.51 
 
 
428 aa  43.9  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2153  hypothetical protein  37.5 
 
 
434 aa  43.5  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>