40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6282 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6282  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  857    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.454076  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4376  hypothetical protein  48.35 
 
 		 455 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0253  hypothetical protein  51.24 
 
 		 455 aa  359  6e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.8172  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4283  hypothetical protein  51.11 
 
 		 451 aa  354  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846286  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1457  hypothetical protein  48.12 
 
 		 451 aa  345  1e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629081  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0229  hypothetical protein  50.48 
 
 		 428 aa  331  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1647  hypothetical protein  27.66 
 
 		 451 aa  94.4  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0794  hypothetical protein  24.39 
 
 		 411 aa  89.7  9e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0494  hypothetical protein  26.18 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1722  hypothetical protein  32.38 
 
 		 460 aa  77.8  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2174  hypothetical protein  30.84 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00796249  hitchhiker  0.00000589334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0901  hypothetical protein  30.9 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2153  hypothetical protein  28.77 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1841  hypothetical protein  26.16 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0686029  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1552  hypothetical protein  26.15 
 
 		 416 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0700  hypothetical protein  26.29 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.694234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0347  hypothetical protein  23.28 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0120833  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1635  peptidase M50  24.66 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0467  hypothetical protein  22.4 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000668675  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0173  hypothetical protein  26.62 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293507  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1436  hypothetical protein  23.81 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1977  hypothetical protein  29.12 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0435007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0560  hypothetical protein  25.66 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.174074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2696  hypothetical protein  28.63 
 
 		 466 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2816  hypothetical protein  27.5 
 
 		 456 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2753  hypothetical protein  27.59 
 
 		 438 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4665  putative transmembrane protein  28.74 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3588  hypothetical protein  28.74 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2393  hypothetical protein  27.16 
 
 		 466 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2894  hypothetical protein  27.16 
 
 		 466 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1707  hypothetical protein  27.16 
 
 		 466 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0267  hypothetical protein  27.62 
 
 		 386 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0620  hypothetical protein  27.16 
 
 		 438 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1802  hypothetical protein  29.71 
 
 		 499 aa  50.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1790  hypothetical protein  27.68 
 
 		 426 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0701  hypothetical protein  23.85 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1160  hypothetical protein  30.9 
 
 		 463 aa  47.4  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.300381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2114  putative transmembrane protein  28.12 
 
 		 426 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.868258  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1889  hypothetical protein  29.66 
 
 		 432 aa  44.3  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1536  hypothetical protein  27.71 
 
 		 427 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>