32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1457 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1457  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  857    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629081  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4376  hypothetical protein  48.45 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4283  hypothetical protein  52.78 
 
 		 451 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846286  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6282  hypothetical protein  48.12 
 
 		 452 aa  341  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.454076  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0253  hypothetical protein  47.65 
 
 		 455 aa  327  3e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.8172  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0229  hypothetical protein  47.14 
 
 		 428 aa  299  7e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0347  hypothetical protein  23.43 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0120833  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0173  hypothetical protein  27.78 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293507  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1647  hypothetical protein  29.38 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1977  hypothetical protein  29.69 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0435007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0794  hypothetical protein  24.67 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1722  hypothetical protein  34.09 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1841  hypothetical protein  25.76 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0686029  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0901  hypothetical protein  25.79 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0700  hypothetical protein  26.68 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.694234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2696  hypothetical protein  28.87 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1436  hypothetical protein  22.45 
 
 		 423 aa  55.1  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1552  hypothetical protein  24.4 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2816  hypothetical protein  28.75 
 
 		 456 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2753  hypothetical protein  28.75 
 
 		 438 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0267  hypothetical protein  27.81 
 
 		 386 aa  51.6  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1707  hypothetical protein  28.45 
 
 		 466 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2894  hypothetical protein  28.45 
 
 		 466 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2393  hypothetical protein  28.45 
 
 		 466 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0620  hypothetical protein  28.45 
 
 		 438 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1536  hypothetical protein  27.06 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4665  putative transmembrane protein  28.57 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3588  hypothetical protein  28.57 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1635  peptidase M50  24.64 
 
 		 396 aa  48.9  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0467  hypothetical protein  20 
 
 		 410 aa  47  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000668675  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2174  hypothetical protein  28.74 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00796249  hitchhiker  0.00000589334 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1160  hypothetical protein  29.82 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.300381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>