43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1647 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1647  hypothetical protein  100 
 
 
451 aa  872    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605477  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0494  hypothetical protein  33.33 
 
 
432 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2174  hypothetical protein  37.47 
 
 
426 aa  137  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00796249  hitchhiker  0.00000589334 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0701  hypothetical protein  32.68 
 
 
436 aa  132  9e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2816  hypothetical protein  35.43 
 
 
456 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2753  hypothetical protein  35.43 
 
 
438 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2696  hypothetical protein  35.17 
 
 
466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1707  hypothetical protein  35.17 
 
 
466 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0620  hypothetical protein  35.17 
 
 
438 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2894  hypothetical protein  35.17 
 
 
466 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2393  hypothetical protein  35.17 
 
 
466 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1889  hypothetical protein  32.66 
 
 
432 aa  118  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1802  hypothetical protein  36.41 
 
 
499 aa  117  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4376  hypothetical protein  30.93 
 
 
455 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0347  hypothetical protein  24.63 
 
 
407 aa  104  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0120833  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0700  hypothetical protein  27.46 
 
 
428 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.694234  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0467  hypothetical protein  25.75 
 
 
410 aa  99.8  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000668675  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0173  hypothetical protein  30.09 
 
 
445 aa  96.3  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293507  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1160  hypothetical protein  28.68 
 
 
463 aa  93.2  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.300381 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1722  hypothetical protein  27.95 
 
 
460 aa  90.1  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0794  hypothetical protein  26.68 
 
 
411 aa  88.2  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6282  hypothetical protein  26.84 
 
 
452 aa  84.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.454076  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0267  hypothetical protein  27.86 
 
 
386 aa  84  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0253  hypothetical protein  28.18 
 
 
455 aa  83.6  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.8172  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4283  hypothetical protein  27.83 
 
 
451 aa  79.7  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846286  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0229  hypothetical protein  28.16 
 
 
428 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1552  hypothetical protein  27.66 
 
 
416 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1436  hypothetical protein  26.58 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0998  hypothetical protein  36.87 
 
 
432 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2153  hypothetical protein  28.84 
 
 
434 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1977  hypothetical protein  26.98 
 
 
434 aa  72.4  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0435007  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4665  putative transmembrane protein  28.75 
 
 
427 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3588  hypothetical protein  28.75 
 
 
427 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1790  hypothetical protein  25.38 
 
 
426 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2114  putative transmembrane protein  26.7 
 
 
426 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.868258  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0901  hypothetical protein  26.26 
 
 
408 aa  64.3  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1457  hypothetical protein  29.46 
 
 
451 aa  63.9  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629081  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0560  hypothetical protein  23.73 
 
 
393 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.174074  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02303  hypothetical protein  28.09 
 
 
406 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1635  peptidase M50  24.25 
 
 
396 aa  55.1  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1841  hypothetical protein  25.71 
 
 
393 aa  55.1  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0686029  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5063  hypothetical protein  39.24 
 
 
462 aa  44.3  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2359  hypothetical protein  27.31 
 
 
425 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>