22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1160 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1160  hypothetical protein  100 
 
 
463 aa  866    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.300381 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1977  hypothetical protein  49.37 
 
 
434 aa  322  6e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0435007  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1722  hypothetical protein  45.37 
 
 
460 aa  306  5.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0173  hypothetical protein  42.21 
 
 
445 aa  299  6e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293507  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0467  hypothetical protein  22.25 
 
 
410 aa  87.8  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000668675  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0347  hypothetical protein  24.17 
 
 
407 aa  85.5  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0120833  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1647  hypothetical protein  29.4 
 
 
451 aa  84.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605477  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1552  hypothetical protein  30.06 
 
 
416 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2153  hypothetical protein  30.21 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0794  hypothetical protein  23.53 
 
 
411 aa  67  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1436  hypothetical protein  23.81 
 
 
423 aa  62  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0494  hypothetical protein  23.12 
 
 
432 aa  60.1  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0267  hypothetical protein  30.19 
 
 
386 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4283  hypothetical protein  27.07 
 
 
451 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846286  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0901  hypothetical protein  31.36 
 
 
408 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4376  hypothetical protein  26.79 
 
 
455 aa  54.7  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2174  hypothetical protein  30.13 
 
 
426 aa  53.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00796249  hitchhiker  0.00000589334 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6282  hypothetical protein  27.22 
 
 
452 aa  50.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.454076  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1457  hypothetical protein  28.49 
 
 
451 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629081  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0253  hypothetical protein  26.67 
 
 
455 aa  47  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.8172  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1536  hypothetical protein  23.59 
 
 
427 aa  47  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1841  hypothetical protein  24.02 
 
 
393 aa  46.6  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0686029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>