37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0494 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0494  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  846    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1647  hypothetical protein  33.33 
 
 
451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605477  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0701  hypothetical protein  31.49 
 
 
436 aa  158  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1889  hypothetical protein  29.58 
 
 
432 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2174  hypothetical protein  34.73 
 
 
426 aa  140  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00796249  hitchhiker  0.00000589334 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1802  hypothetical protein  27.51 
 
 
499 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2753  hypothetical protein  28.72 
 
 
438 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2816  hypothetical protein  28.72 
 
 
456 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1707  hypothetical protein  28.46 
 
 
466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2696  hypothetical protein  28.46 
 
 
466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2894  hypothetical protein  28.46 
 
 
466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2393  hypothetical protein  28.46 
 
 
466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0620  hypothetical protein  28.46 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0998  hypothetical protein  35.07 
 
 
432 aa  99.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3588  hypothetical protein  27.03 
 
 
427 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4665  putative transmembrane protein  27.03 
 
 
427 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0467  hypothetical protein  25.6 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000668675  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02303  hypothetical protein  26.33 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1790  hypothetical protein  24.8 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2114  putative transmembrane protein  25.81 
 
 
426 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.868258  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0794  hypothetical protein  25.2 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1841  hypothetical protein  27.04 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0686029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0700  hypothetical protein  23.33 
 
 
428 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.694234  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6282  hypothetical protein  23.59 
 
 
452 aa  63.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.454076  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0347  hypothetical protein  27.25 
 
 
407 aa  59.7  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0120833  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1160  hypothetical protein  23.51 
 
 
463 aa  58.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.300381 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1436  hypothetical protein  23.86 
 
 
423 aa  56.2  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4376  hypothetical protein  23.2 
 
 
455 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5063  hypothetical protein  36.36 
 
 
462 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1552  hypothetical protein  28.87 
 
 
416 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0173  hypothetical protein  23.01 
 
 
445 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293507  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0267  hypothetical protein  24.86 
 
 
386 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0560  hypothetical protein  24.86 
 
 
393 aa  50.4  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.174074  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2153  hypothetical protein  33.98 
 
 
434 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1635  peptidase M50  30.46 
 
 
396 aa  47.8  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2084  hypothetical protein  39.44 
 
 
444 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.506799 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4283  hypothetical protein  22.5 
 
 
451 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>