43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0467 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0467  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  783    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000668675  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0347  hypothetical protein  37.47 
 
 		 407 aa  218  1e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0120833  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1436  hypothetical protein  32.54 
 
 		 423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0794  hypothetical protein  30.7 
 
 		 411 aa  170  4e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0560  hypothetical protein  33.08 
 
 		 393 aa  143  7e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.174074  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1841  hypothetical protein  32.29 
 
 		 393 aa  129  8.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0686029  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1635  peptidase M50  30.81 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1552  hypothetical protein  28.26 
 
 		 416 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0267  hypothetical protein  27.33 
 
 		 386 aa  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0494  hypothetical protein  26.47 
 
 		 432 aa  100  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1160  hypothetical protein  22.17 
 
 		 463 aa  98.2  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.300381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1647  hypothetical protein  23.44 
 
 		 451 aa  97.1  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0901  hypothetical protein  23.66 
 
 		 408 aa  89.7  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0173  hypothetical protein  21.45 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293507  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1722  hypothetical protein  23.14 
 
 		 460 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1977  hypothetical protein  20.78 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0435007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4376  hypothetical protein  22.55 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0700  hypothetical protein  21.53 
 
 		 428 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.694234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2153  hypothetical protein  23.42 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2174  hypothetical protein  23.49 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00796249  hitchhiker  0.00000589334 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6282  hypothetical protein  21.54 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.454076  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2816  hypothetical protein  23.14 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2696  hypothetical protein  23.14 
 
 		 466 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2753  hypothetical protein  23.14 
 
 		 438 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1536  hypothetical protein  22.25 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0253  hypothetical protein  23.68 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.8172  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0229  hypothetical protein  23.68 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4283  hypothetical protein  22.09 
 
 		 451 aa  62  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846286  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0620  hypothetical protein  23.14 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2393  hypothetical protein  23.14 
 
 		 466 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1707  hypothetical protein  23.14 
 
 		 466 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2894  hypothetical protein  23.14 
 
 		 466 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1889  hypothetical protein  22.43 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3588  hypothetical protein  19.71 
 
 		 427 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4665  putative transmembrane protein  19.71 
 
 		 427 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1457  hypothetical protein  19.88 
 
 		 451 aa  53.1  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629081  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2114  putative transmembrane protein  21.16 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.868258  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2359  hypothetical protein  27.27 
 
 		 425 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1802  hypothetical protein  21.34 
 
 		 499 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0701  hypothetical protein  25.23 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1272  hypothetical protein  25 
 
 		 376 aa  43.5  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0158  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  38.18 
 
 		 495 aa  43.5  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.363228 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3000  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  38.18 
 
 		 496 aa  43.1  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0591739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>