40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2753 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_1707  hypothetical protein  99.32 
 
 
466 aa  830    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2753  hypothetical protein  100 
 
 
438 aa  835    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0620  hypothetical protein  99.32 
 
 
438 aa  829    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2696  hypothetical protein  99.09 
 
 
466 aa  827    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2894  hypothetical protein  99.32 
 
 
466 aa  830    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2816  hypothetical protein  99.77 
 
 
456 aa  828    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2393  hypothetical protein  99.32 
 
 
466 aa  830    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1802  hypothetical protein  87.05 
 
 
499 aa  548  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1889  hypothetical protein  38.18 
 
 
432 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2174  hypothetical protein  41.15 
 
 
426 aa  172  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00796249  hitchhiker  0.00000589334 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0494  hypothetical protein  27.88 
 
 
432 aa  152  8.999999999999999e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0701  hypothetical protein  28.41 
 
 
436 aa  143  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1647  hypothetical protein  35.71 
 
 
451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605477  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3588  hypothetical protein  32.62 
 
 
427 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4665  putative transmembrane protein  32.62 
 
 
427 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0998  hypothetical protein  40.62 
 
 
432 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02303  hypothetical protein  31.83 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1790  hypothetical protein  29.43 
 
 
426 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2114  putative transmembrane protein  28 
 
 
426 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.868258  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2084  hypothetical protein  31.87 
 
 
444 aa  79.7  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.506799 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0467  hypothetical protein  22.83 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000668675  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0267  hypothetical protein  28.85 
 
 
386 aa  67  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6282  hypothetical protein  27.44 
 
 
452 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.454076  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0794  hypothetical protein  22.63 
 
 
411 aa  60.5  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1457  hypothetical protein  28.87 
 
 
451 aa  60.5  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629081  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1436  hypothetical protein  25.32 
 
 
423 aa  58.9  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0347  hypothetical protein  21.93 
 
 
407 aa  57  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0120833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1552  hypothetical protein  28.5 
 
 
416 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4283  hypothetical protein  26.46 
 
 
451 aa  56.6  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846286  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1841  hypothetical protein  24.91 
 
 
393 aa  55.8  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0686029  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2153  hypothetical protein  29.82 
 
 
434 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0901  hypothetical protein  28.27 
 
 
408 aa  53.1  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4376  hypothetical protein  25.85 
 
 
455 aa  52.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1977  hypothetical protein  31.98 
 
 
434 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0435007  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5063  hypothetical protein  44.16 
 
 
462 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0253  hypothetical protein  28.92 
 
 
455 aa  47.4  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.8172  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0229  hypothetical protein  28.92 
 
 
428 aa  47.4  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0700  hypothetical protein  22.78 
 
 
428 aa  47  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.694234  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1536  hypothetical protein  28.96 
 
 
427 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1160  hypothetical protein  26.7 
 
 
463 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.300381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>