22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5063 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5063  hypothetical protein  100 
 
 
462 aa  853    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2084  hypothetical protein  66.05 
 
 
444 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.506799 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3588  hypothetical protein  53.46 
 
 
427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4665  putative transmembrane protein  53.46 
 
 
427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1790  hypothetical protein  50.84 
 
 
426 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_003296  RS02303  hypothetical protein  53.37 
 
 
406 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2114  putative transmembrane protein  51.08 
 
 
426 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.868258  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1889  hypothetical protein  34.25 
 
 
432 aa  106  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0494  hypothetical protein  29.77 
 
 
432 aa  106  9e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2174  hypothetical protein  35.65 
 
 
426 aa  85.9  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00796249  hitchhiker  0.00000589334 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2393  hypothetical protein  31.59 
 
 
466 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2894  hypothetical protein  31.59 
 
 
466 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1707  hypothetical protein  31.59 
 
 
466 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2816  hypothetical protein  32.17 
 
 
456 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0620  hypothetical protein  31.59 
 
 
438 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2696  hypothetical protein  31.85 
 
 
466 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2753  hypothetical protein  30.75 
 
 
438 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1802  hypothetical protein  32.52 
 
 
499 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1647  hypothetical protein  28.38 
 
 
451 aa  67.4  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605477  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0998  hypothetical protein  43 
 
 
432 aa  61.6  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0701  hypothetical protein  24.43 
 
 
436 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4283  hypothetical protein  35.83 
 
 
451 aa  50.1  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>